More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1176 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  783    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  54.6 
 
 
372 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0013  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  37.3 
 
 
540 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.22 
 
 
383 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.69 
 
 
383 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.42 
 
 
385 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.56 
 
 
387 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  27.47 
 
 
386 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  32.18 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  28.07 
 
 
409 aa  169  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  30.26 
 
 
639 aa  169  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  30.26 
 
 
643 aa  162  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.54 
 
 
664 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  28.5 
 
 
659 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  31.83 
 
 
658 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.81 
 
 
664 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.39 
 
 
655 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.59 
 
 
658 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  27.98 
 
 
692 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  27.18 
 
 
652 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  30.08 
 
 
617 aa  156  7e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.89 
 
 
721 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  29.6 
 
 
655 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  28.42 
 
 
688 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  28.08 
 
 
549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 
686 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  26.65 
 
 
1388 aa  153  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  25.55 
 
 
661 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.04 
 
 
658 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  29.55 
 
 
716 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  30 
 
 
1015 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.4 
 
 
656 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.98 
 
 
737 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  28.86 
 
 
699 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  27.51 
 
 
588 aa  149  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  29.41 
 
 
716 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  28.96 
 
 
732 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  28.71 
 
 
718 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.15 
 
 
656 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  28.82 
 
 
752 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.03 
 
 
494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.11 
 
 
774 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.14 
 
 
717 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.21 
 
 
723 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.78 
 
 
722 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  27.71 
 
 
703 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  27.68 
 
 
661 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4016  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.68 
 
 
265 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112727  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  27.11 
 
 
727 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.12 
 
 
694 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.2 
 
 
714 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.7 
 
 
713 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.67 
 
 
641 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  26.65 
 
 
1033 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  29.75 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  29.84 
 
 
661 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.2 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  29.21 
 
 
720 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  27.68 
 
 
683 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  26.05 
 
 
678 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.94 
 
 
722 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  27.35 
 
 
730 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.33 
 
 
758 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.73 
 
 
662 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.3 
 
 
683 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.31 
 
 
481 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.76 
 
 
748 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  27.59 
 
 
654 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.15 
 
 
762 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  26.05 
 
 
727 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.88 
 
 
662 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  27.89 
 
 
629 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  27.89 
 
 
703 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.93 
 
 
494 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  31.56 
 
 
1027 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  27.89 
 
 
703 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  27.89 
 
 
703 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  27.89 
 
 
703 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  27.89 
 
 
703 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  27.89 
 
 
703 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.21 
 
 
663 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  27.89 
 
 
703 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  26.94 
 
 
739 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0123  Fe-S oxidoreductase, dehydrogenase subunit  33.47 
 
 
262 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.63 
 
 
679 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  30.31 
 
 
1044 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.26 
 
 
694 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.03 
 
 
1046 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  31.03 
 
 
1046 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  31.03 
 
 
1042 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  27.89 
 
 
703 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  28.5 
 
 
661 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  27.89 
 
 
703 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  26.55 
 
 
720 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.08 
 
 
676 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  26.6 
 
 
762 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.74 
 
 
699 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5544  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.2 
 
 
267 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  27.27 
 
 
703 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.77 
 
 
712 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>