More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3271 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 
763 aa  1585    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.22 
 
 
796 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  37.58 
 
 
769 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.76 
 
 
776 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.11 
 
 
784 aa  523  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  35.26 
 
 
771 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.68 
 
 
771 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  33.12 
 
 
788 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  32.37 
 
 
768 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.33 
 
 
758 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
797 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  30.45 
 
 
836 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.94 
 
 
902 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.87 
 
 
802 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  27.59 
 
 
370 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  27.3 
 
 
370 aa  137  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  27.39 
 
 
423 aa  134  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  25.07 
 
 
392 aa  125  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  29.68 
 
 
256 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  24.57 
 
 
347 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.24 
 
 
411 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  24.37 
 
 
623 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  23.87 
 
 
665 aa  112  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.96 
 
 
412 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.08 
 
 
609 aa  111  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2948  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain- containing protein  22.53 
 
 
366 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  33.12 
 
 
488 aa  91.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  34.16 
 
 
488 aa  90.9  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  32.5 
 
 
488 aa  89.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.61 
 
 
578 aa  89.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  32.61 
 
 
491 aa  89  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.16 
 
 
612 aa  89  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.91 
 
 
578 aa  88.6  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  34.06 
 
 
492 aa  87.4  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.64 
 
 
1487 aa  87.4  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.35 
 
 
617 aa  86.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  29.87 
 
 
480 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0903  hypothetical protein  24.15 
 
 
367 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  29.38 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  28.24 
 
 
494 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1873  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.27 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.93 
 
 
577 aa  84.7  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  29.87 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  30.67 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.09 
 
 
612 aa  84.3  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.61 
 
 
578 aa  83.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  29.26 
 
 
997 aa  83.6  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  33.09 
 
 
491 aa  83.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.03 
 
 
461 aa  84  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  31.16 
 
 
489 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  31.25 
 
 
492 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  33.33 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  32.52 
 
 
488 aa  83.2  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  31.06 
 
 
492 aa  82.4  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  30.83 
 
 
599 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  30.38 
 
 
486 aa  82  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  26.52 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  31.25 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  31.16 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  24.33 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  31.16 
 
 
487 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  27.85 
 
 
492 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  31.16 
 
 
487 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  32.93 
 
 
485 aa  80.5  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  29.87 
 
 
492 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  29.71 
 
 
488 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  31.25 
 
 
501 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  29.7 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1874  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.18 
 
 
377 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  29.71 
 
 
488 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  31.16 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  31.16 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  28.99 
 
 
481 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  31.06 
 
 
472 aa  79  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  27.27 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  28.57 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  26.13 
 
 
579 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  29.22 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.38 
 
 
598 aa  77.8  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  26.44 
 
 
578 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.81 
 
 
653 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  29.63 
 
 
494 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  30.77 
 
 
501 aa  77.4  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  29.61 
 
 
501 aa  77  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3730  glutamate synthase subunit beta  30.67 
 
 
484 aa  76.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178567  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  30.43 
 
 
478 aa  76.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  29.78 
 
 
486 aa  76.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  28.57 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  28.57 
 
 
492 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  30 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  29.73 
 
 
489 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  25.62 
 
 
1075 aa  75.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  28.57 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  27.92 
 
 
488 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  27.89 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
598 aa  76.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
596 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  30.82 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  27.92 
 
 
486 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  28.99 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>