More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2823 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  91.83 
 
 
502 aa  953    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  70.83 
 
 
501 aa  720    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  69.64 
 
 
500 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  74.3 
 
 
501 aa  769    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  87.05 
 
 
502 aa  892    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  87.05 
 
 
502 aa  892    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 
502 aa  1015    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  87.25 
 
 
502 aa  896    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  60.89 
 
 
480 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  58.05 
 
 
486 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  59.6 
 
 
481 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.61 
 
 
487 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  61.88 
 
 
488 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  60.32 
 
 
485 aa  545  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.36 
 
 
484 aa  547  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.35 
 
 
495 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.69 
 
 
501 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.35 
 
 
492 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.88 
 
 
486 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.82 
 
 
488 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  56.02 
 
 
493 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.88 
 
 
501 aa  508  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  57.71 
 
 
488 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  56.78 
 
 
494 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  56.5 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  56.83 
 
 
489 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  56.83 
 
 
489 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.75 
 
 
485 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  56.3 
 
 
491 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.58 
 
 
489 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  53.57 
 
 
485 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  56.63 
 
 
488 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.8 
 
 
487 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.58 
 
 
488 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.49 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.85 
 
 
486 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.14 
 
 
484 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.44 
 
 
491 aa  485  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.08 
 
 
488 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.42 
 
 
471 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.06 
 
 
475 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  54.17 
 
 
485 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.1 
 
 
487 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.06 
 
 
492 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.34 
 
 
494 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  47.85 
 
 
502 aa  455  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  48.58 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  46.63 
 
 
500 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.31 
 
 
496 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  49.3 
 
 
488 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  48.89 
 
 
479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  48.48 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  49.6 
 
 
487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.7 
 
 
495 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.7 
 
 
495 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.02 
 
 
494 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  48.41 
 
 
491 aa  444  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.2 
 
 
495 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.4 
 
 
478 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.7 
 
 
495 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  46.77 
 
 
482 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  47.78 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  48.32 
 
 
487 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  48.72 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  47.18 
 
 
477 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.5 
 
 
495 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  47.18 
 
 
477 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  49.12 
 
 
487 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  47.35 
 
 
512 aa  438  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  47.72 
 
 
496 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  45.94 
 
 
493 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  47.54 
 
 
488 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.8 
 
 
484 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  47.06 
 
 
491 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  45.55 
 
 
489 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  47.44 
 
 
488 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  48.13 
 
 
487 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  47.74 
 
 
487 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  49.51 
 
 
488 aa  431  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  47.82 
 
 
491 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.69 
 
 
491 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  44.53 
 
 
489 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  45.85 
 
 
488 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  45.99 
 
 
491 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  46.98 
 
 
472 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  46.14 
 
 
494 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.76 
 
 
482 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  47.42 
 
 
491 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  47.17 
 
 
492 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  46.68 
 
 
492 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.63 
 
 
489 aa  423  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  46.02 
 
 
491 aa  425  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  47.41 
 
 
484 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  45.62 
 
 
491 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  46.48 
 
 
492 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  45.53 
 
 
2135 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.32 
 
 
493 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  46.53 
 
 
484 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2743  glutamate synthase subunit beta  47.91 
 
 
484 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.664254  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1987  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.09 
 
 
485 aa  420  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>