More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2216 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  77.02 
 
 		 488 aa  773    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  76.95 
 
 		 491 aa  749    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  68.24 
 
 		 485 aa  666    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  72.31 
 
 		 488 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 		 488 aa  987    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  69.34 
 
 		 487 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  68.24 
 
 		 485 aa  683    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  64.55 
 
 		 486 aa  627  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  63.6 
 
 		 486 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.45 
 
 		 485 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.89 
 
 		 485 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  62.22 
 
 		 493 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.8 
 
 		 488 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.88 
 
 		 487 aa  591  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.7 
 
 		 484 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.33 
 
 		 484 aa  578  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  60.2 
 
 		 492 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  61.43 
 
 		 489 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  61.43 
 
 		 489 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  60.53 
 
 		 492 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  61.3 
 
 		 488 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.93 
 
 		 494 aa  570  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  59.92 
 
 		 491 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  61.02 
 
 		 488 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.42 
 
 		 495 aa  555  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  59.79 
 
 		 481 aa  552  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  58.72 
 
 		 494 aa  547  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  54.6 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  60.41 
 
 		 486 aa  544  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  59.79 
 
 		 480 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.6 
 
 		 489 aa  518  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.98 
 
 		 501 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.76 
 
 		 487 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.68 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.86 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.86 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.86 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.64 
 
 		 492 aa  495  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.47 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.68 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.7 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.74 
 
 		 495 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.04 
 
 		 475 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  49.7 
 
 		 500 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.59 
 
 		 500 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  54.08 
 
 		 502 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  51.52 
 
 		 488 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  57.96 
 
 		 488 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.75 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  51.91 
 
 		 491 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.68 
 
 		 501 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.51 
 
 		 496 aa  475  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  52.63 
 
 		 488 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  48.7 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  51.22 
 
 		 488 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  51.42 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.04 
 
 		 478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.41 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.2 
 
 		 495 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  50.62 
 
 		 479 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.2 
 
 		 495 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  52.13 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  50.71 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  51.01 
 
 		 489 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  52.33 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  51.21 
 
 		 489 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  50.91 
 
 		 487 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.95 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.21 
 
 		 495 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  48.55 
 
 		 490 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.18 
 
 		 482 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  51.57 
 
 		 492 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  50.71 
 
 		 487 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  48.35 
 
 		 489 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  49.9 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  48.35 
 
 		 489 aa  458  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  48.14 
 
 		 489 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 487 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.79 
 
 		 494 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  50.71 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  52.39 
 
 		 492 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.2 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  49.69 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  49.9 
 
 		 492 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1987  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.8 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  48.99 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  51.72 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  48.99 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.98 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  52.13 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.42 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  51.93 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  52.13 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  50.91 
 
 		 487 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  51.93 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  49.06 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  51.42 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  46.81 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  48.39 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>