More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3806 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 		 488 aa  988    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  67.33 
 
 		 501 aa  625  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  68.34 
 
 		 501 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  61.88 
 
 		 502 aa  591  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.88 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  62.08 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.88 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.28 
 
 		 502 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.4 
 
 		 501 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.96 
 
 		 487 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.48 
 
 		 501 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.52 
 
 		 500 aa  568  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.92 
 
 		 485 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  62.32 
 
 		 480 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  58.57 
 
 		 486 aa  547  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  58.85 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  58.8 
 
 		 494 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  60.57 
 
 		 489 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 492 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.99 
 
 		 484 aa  547  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  60.57 
 
 		 489 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.74 
 
 		 485 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.72 
 
 		 488 aa  535  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.51 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.54 
 
 		 492 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  57.35 
 
 		 485 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  59.23 
 
 		 488 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.96 
 
 		 488 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  59.43 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  57.56 
 
 		 485 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.63 
 
 		 491 aa  521  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.35 
 
 		 488 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  56.97 
 
 		 491 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.32 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.08 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  56.63 
 
 		 493 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.24 
 
 		 486 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.35 
 
 		 471 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.36 
 
 		 487 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.71 
 
 		 487 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.52 
 
 		 486 aa  495  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.99 
 
 		 492 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.72 
 
 		 489 aa  481  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.3 
 
 		 475 aa  477  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.67 
 
 		 495 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.36 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  46.34 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  49.08 
 
 		 488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.78 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  48.11 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  48.96 
 
 		 479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.26 
 
 		 482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  49.19 
 
 		 488 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  47.17 
 
 		 512 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  47.36 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.69 
 
 		 478 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  49.07 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  48.18 
 
 		 488 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.7 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  48.2 
 
 		 492 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  49.07 
 
 		 477 aa  435  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  47.2 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  48.12 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1818  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.78 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.985606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.67 
 
 		 495 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.13 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  46.95 
 
 		 489 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  47.57 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  46.65 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.78 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.78 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.97 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  48.04 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  48.04 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  47.9 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  46.68 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  46.37 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  46.36 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  47.82 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  50.4 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  47.19 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  45.97 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.68 
 
 		 482 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.17 
 
 		 477 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  46.02 
 
 		 488 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  48.89 
 
 		 487 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.16 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  47.39 
 
 		 492 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  46.08 
 
 		 496 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.09 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.31 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  46.45 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  46.6 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  45.1 
 
 		 580 aa  415  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  46.88 
 
 		 491 aa  415  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  45.86 
 
 		 485 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  47.76 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  47.68 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  46.77 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.8 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>