More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2693 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  62.35 
 
 
491 aa  635    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.39 
 
 
495 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 
489 aa  1012    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.23 
 
 
493 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  62.09 
 
 
490 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  68.11 
 
 
461 aa  637    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  63.6 
 
 
495 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  70.24 
 
 
494 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  65.3 
 
 
495 aa  650    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  65.66 
 
 
493 aa  679    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.6 
 
 
495 aa  638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.03 
 
 
493 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  60.24 
 
 
491 aa  621  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  60.4 
 
 
491 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  59.84 
 
 
494 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  60.73 
 
 
491 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  61.46 
 
 
491 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  61.34 
 
 
492 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  60.65 
 
 
491 aa  610  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  59.03 
 
 
493 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  59.6 
 
 
496 aa  607  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  59.23 
 
 
2126 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  57.83 
 
 
580 aa  596  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.34 
 
 
506 aa  568  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.49 
 
 
494 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0947  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.65 
 
 
505 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  54.67 
 
 
2135 aa  546  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  53.59 
 
 
2126 aa  542  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.94 
 
 
471 aa  535  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  54.35 
 
 
500 aa  538  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.06 
 
 
485 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.67 
 
 
487 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.82 
 
 
492 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.26 
 
 
489 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.52 
 
 
492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  51.58 
 
 
502 aa  511  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.58 
 
 
496 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.13 
 
 
484 aa  505  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.04 
 
 
484 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.92 
 
 
491 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  53.02 
 
 
486 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.85 
 
 
484 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  52.41 
 
 
494 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  53.74 
 
 
489 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  54.22 
 
 
492 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  53.74 
 
 
489 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.13 
 
 
488 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  51 
 
 
489 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  52.34 
 
 
481 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.22 
 
 
478 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  51 
 
 
489 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  50.4 
 
 
479 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.52 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  51.61 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  49.8 
 
 
480 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.77 
 
 
482 aa  490  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  50.8 
 
 
490 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.32 
 
 
482 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  51.92 
 
 
493 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.8 
 
 
488 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.89 
 
 
495 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  49.1 
 
 
488 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  52.86 
 
 
480 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  53.82 
 
 
491 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.7 
 
 
488 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  54.34 
 
 
488 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.61 
 
 
491 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  50.1 
 
 
489 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  51.72 
 
 
484 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 
485 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  50.41 
 
 
485 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.91 
 
 
488 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  50.6 
 
 
488 aa  475  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  49.6 
 
 
487 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  52.93 
 
 
488 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  49.7 
 
 
489 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  49.39 
 
 
472 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  51.19 
 
 
487 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 
481 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  51.21 
 
 
484 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  49.6 
 
 
487 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.98 
 
 
485 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  48.51 
 
 
488 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  48.71 
 
 
488 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  49.4 
 
 
487 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.25 
 
 
486 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  50.1 
 
 
491 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.1 
 
 
495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  49.7 
 
 
487 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  49.21 
 
 
488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  49.39 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 
489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  49.6 
 
 
488 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  51.09 
 
 
488 aa  467  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  49.02 
 
 
492 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 
473 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  49.02 
 
 
492 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  49.39 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 
484 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  49.8 
 
 
485 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>