More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3012 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  70.69 
 
 		 484 aa  675    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  86.67 
 
 		 481 aa  833    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  69.85 
 
 		 485 aa  675    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  68.61 
 
 		 484 aa  680    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  69.53 
 
 		 492 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  70.66 
 
 		 487 aa  695    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 480 aa  969    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  69.96 
 
 		 488 aa  670    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  70.61 
 
 		 495 aa  702    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  68.23 
 
 		 494 aa  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  72.93 
 
 		 488 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  71.66 
 
 		 491 aa  687    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  73.55 
 
 		 489 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  73.31 
 
 		 492 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  73.55 
 
 		 489 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  73.76 
 
 		 488 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  65.5 
 
 		 486 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  67.28 
 
 		 493 aa  631  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  69.63 
 
 		 486 aa  624  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  62.58 
 
 		 485 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.73 
 
 		 485 aa  594  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  62.31 
 
 		 471 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  62.79 
 
 		 485 aa  579  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.62 
 
 		 502 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.49 
 
 		 487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.62 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.62 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  60.89 
 
 		 502 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.89 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  61 
 
 		 488 aa  564  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60 
 
 		 500 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.88 
 
 		 501 aa  561  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.69 
 
 		 489 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.79 
 
 		 488 aa  558  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.7 
 
 		 501 aa  557  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.78 
 
 		 491 aa  552  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  54.21 
 
 		 500 aa  552  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.75 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.76 
 
 		 496 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.35 
 
 		 495 aa  534  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.88 
 
 		 478 aa  531  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  62.32 
 
 		 488 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.58 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  56.16 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  56.04 
 
 		 480 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.04 
 
 		 487 aa  523  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  60.25 
 
 		 475 aa  522  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  56.21 
 
 		 472 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.07 
 
 		 482 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  56.03 
 
 		 487 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  52.98 
 
 		 502 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.15 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  56.44 
 
 		 488 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  53.66 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.03 
 
 		 491 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.94 
 
 		 486 aa  513  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  54.4 
 
 		 487 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.39 
 
 		 492 aa  508  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  53.37 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  52.76 
 
 		 488 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  53.39 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  53.33 
 
 		 489 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  53.06 
 
 		 489 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  52.74 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.55 
 
 		 495 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  53.14 
 
 		 492 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  52.29 
 
 		 490 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.08 
 
 		 488 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.88 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.34 
 
 		 495 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.12 
 
 		 494 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.55 
 
 		 495 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  53.12 
 
 		 489 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  52.76 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  52.65 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  52.82 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.86 
 
 		 489 aa  499  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  52.97 
 
 		 487 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  52.66 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  52.74 
 
 		 492 aa  500  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  53.17 
 
 		 487 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.71 
 
 		 495 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  52.08 
 
 		 489 aa  498  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  53.78 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  51.63 
 
 		 491 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  53.37 
 
 		 487 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  54 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  54.21 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.12 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.52 
 
 		 493 aa  488  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.84 
 
 		 484 aa  488  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  54.4 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  53.07 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  53.07 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  54.21 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  54.19 
 
 		 488 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  53.58 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  54.19 
 
 		 488 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>