More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5692 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  69.64 
 
 		 502 aa  713    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  75.65 
 
 		 501 aa  788    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 		 500 aa  1013    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  69.44 
 
 		 502 aa  706    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  66.33 
 
 		 501 aa  666    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  69.44 
 
 		 502 aa  706    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  69.64 
 
 		 502 aa  711    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  69.84 
 
 		 502 aa  710    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.7 
 
 		 501 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  60.24 
 
 		 481 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  58.17 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.33 
 
 		 487 aa  542  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.02 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.99 
 
 		 495 aa  538  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.88 
 
 		 485 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  59.52 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.12 
 
 		 501 aa  527  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  58.73 
 
 		 488 aa  528  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.48 
 
 		 492 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.2 
 
 		 484 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56 
 
 		 485 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.43 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  56.66 
 
 		 488 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  56.32 
 
 		 491 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  56.47 
 
 		 494 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  59 
 
 		 486 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  55.93 
 
 		 493 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  56.61 
 
 		 492 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 489 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 489 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.93 
 
 		 487 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  53.78 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.2 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.07 
 
 		 489 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.59 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  53.98 
 
 		 485 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.1 
 
 		 475 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.16 
 
 		 488 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.38 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.06 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.51 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  50.69 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.1 
 
 		 487 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.41 
 
 		 495 aa  462  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 		 491 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  49.71 
 
 		 492 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  49.31 
 
 		 488 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  50.72 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.01 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  49.49 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  49.71 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  49.11 
 
 		 488 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  49.51 
 
 		 492 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  49.29 
 
 		 479 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  48.23 
 
 		 491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  49.5 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.79 
 
 		 482 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  50.69 
 
 		 487 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  48.02 
 
 		 487 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  48.57 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  51.49 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  48.79 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  48.8 
 
 		 484 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  48.47 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  48.79 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.21 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  46.67 
 
 		 502 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.09 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.4 
 
 		 495 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  47.83 
 
 		 488 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  47.82 
 
 		 487 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  46.99 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.71 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.81 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.81 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  46.41 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  47.33 
 
 		 487 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  49 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  48.3 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.71 
 
 		 495 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  47.22 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  48.61 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.39 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.53 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  46.43 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.71 
 
 		 489 aa  428  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  46.93 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  49.31 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  46.61 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  49.12 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1987  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.97 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  48.21 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.75 
 
 		 484 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.08 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  46.53 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  46.6 
 
 		 484 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  47 
 
 		 484 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>