More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0609 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 
492 aa  1002    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.8 
 
 
489 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.75 
 
 
485 aa  478  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.82 
 
 
484 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.93 
 
 
487 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.53 
 
 
492 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  51.12 
 
 
479 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  49.27 
 
 
480 aa  458  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.6 
 
 
492 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.04 
 
 
471 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  49.9 
 
 
494 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  49.29 
 
 
493 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.06 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  49.69 
 
 
488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.28 
 
 
494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  47.55 
 
 
488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.2 
 
 
495 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  49.29 
 
 
494 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  49.18 
 
 
488 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  49.18 
 
 
488 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  49.69 
 
 
493 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.1 
 
 
495 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  47.37 
 
 
492 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  48.88 
 
 
489 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.27 
 
 
488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  50.84 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.84 
 
 
495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.27 
 
 
489 aa  445  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  46.54 
 
 
488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  48.88 
 
 
489 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  48.68 
 
 
491 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.35 
 
 
461 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  48.97 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  49.38 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  49.48 
 
 
489 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  45.47 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  49.48 
 
 
489 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  49.39 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.74 
 
 
484 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.98 
 
 
495 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.98 
 
 
495 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.98 
 
 
495 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  45.91 
 
 
490 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  50.21 
 
 
475 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  47.46 
 
 
488 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  49.48 
 
 
481 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  47.68 
 
 
492 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  46.49 
 
 
488 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.58 
 
 
484 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  45.26 
 
 
489 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.58 
 
 
493 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  45.82 
 
 
489 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.1 
 
 
482 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  45.75 
 
 
491 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  46.29 
 
 
496 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  46.86 
 
 
491 aa  430  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  47.26 
 
 
487 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  45.19 
 
 
489 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  46.94 
 
 
487 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.49 
 
 
491 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  46.73 
 
 
487 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.24 
 
 
488 aa  428  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  47.57 
 
 
484 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  45.1 
 
 
488 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  48.98 
 
 
488 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  48.21 
 
 
472 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  46.84 
 
 
491 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  48.43 
 
 
485 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 
488 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  47.44 
 
 
2126 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  46.26 
 
 
492 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  47.36 
 
 
491 aa  423  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  49.18 
 
 
488 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  47.76 
 
 
487 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  46.12 
 
 
487 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  49 
 
 
505 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  45.09 
 
 
482 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1818  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.28 
 
 
523 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.985606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.7 
 
 
488 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  46.73 
 
 
491 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.76 
 
 
496 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  48.57 
 
 
488 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  48.37 
 
 
488 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  47.36 
 
 
485 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.33 
 
 
491 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  47.15 
 
 
484 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  48.98 
 
 
488 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  48.57 
 
 
488 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  48.98 
 
 
488 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  48.98 
 
 
488 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  46.14 
 
 
490 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  48.57 
 
 
488 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.08 
 
 
500 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  48.37 
 
 
488 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  45.66 
 
 
2135 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  48.37 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  48.64 
 
 
485 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.5 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  48.37 
 
 
488 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>