More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3391 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  91.62 
 
 		 501 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 		 501 aa  992    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  69.34 
 
 		 488 aa  632  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  60.94 
 
 		 501 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.12 
 
 		 500 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.66 
 
 		 502 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  60.36 
 
 		 485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  59.88 
 
 		 502 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.34 
 
 		 502 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.73 
 
 		 502 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.73 
 
 		 502 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.06 
 
 		 501 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.2 
 
 		 484 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.52 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  59.2 
 
 		 481 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  59.72 
 
 		 492 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  59.52 
 
 		 491 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  57.25 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.28 
 
 		 492 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  57.06 
 
 		 486 aa  535  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.95 
 
 		 487 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  61 
 
 		 488 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  59.6 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  59.6 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.56 
 
 		 495 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  59.8 
 
 		 488 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  59.72 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  59.02 
 
 		 493 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.6 
 
 		 485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  55.98 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.75 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.94 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.65 
 
 		 486 aa  502  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.62 
 
 		 491 aa  498  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.51 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.38 
 
 		 488 aa  498  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.51 
 
 		 471 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  55.78 
 
 		 485 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.18 
 
 		 486 aa  482  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.35 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  48.37 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.98 
 
 		 487 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.06 
 
 		 475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.04 
 
 		 487 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.1 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.57 
 
 		 489 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  50.51 
 
 		 479 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  49.8 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.78 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  47.71 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.76 
 
 		 492 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  49.9 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.98 
 
 		 482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.12 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.83 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  48.98 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  49.11 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  48.22 
 
 		 488 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.84 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  48.37 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  47.73 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  48.39 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  48.43 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.6 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.8 
 
 		 478 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.8 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  48.11 
 
 		 484 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  48.51 
 
 		 485 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  48.31 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  48.78 
 
 		 477 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  47.99 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.04 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  46.57 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.6 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.67 
 
 		 482 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  47.45 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  47.53 
 
 		 488 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  47.74 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  49.31 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  47.95 
 
 		 488 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  46.67 
 
 		 488 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  46.95 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  47.72 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  50.79 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  47.95 
 
 		 488 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  46.37 
 
 		 489 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.8 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  45.82 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  47.56 
 
 		 477 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  50.1 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1172  glutamate synthase subunit beta  49.8 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203047  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  47.05 
 
 		 487 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  47.56 
 
 		 477 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  48.34 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  45.97 
 
 		 489 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1818  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.92 
 
 		 523 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.985606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  46.64 
 
 		 487 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  47.72 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  46.76 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>