More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0782 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 491 aa  1023    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  80.86 
 
 		 491 aa  836    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.71 
 
 		 493 aa  658    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  62.99 
 
 		 490 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  77.03 
 
 		 492 aa  797    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  79.63 
 
 		 491 aa  829    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.35 
 
 		 494 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  73.12 
 
 		 491 aa  789    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  80.04 
 
 		 491 aa  848    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.49 
 
 		 493 aa  634    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  73.52 
 
 		 491 aa  780    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.29 
 
 		 493 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.24 
 
 		 489 aa  621  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.49 
 
 		 495 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.69 
 
 		 461 aa  607  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.05 
 
 		 506 aa  594  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0947  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.71 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  58.59 
 
 		 494 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  57.78 
 
 		 493 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.67 
 
 		 495 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.87 
 
 		 495 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.87 
 
 		 495 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  56.54 
 
 		 496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.4 
 
 		 494 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  52.85 
 
 		 2135 aa  550  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  51.72 
 
 		 2126 aa  535  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  52.22 
 
 		 2126 aa  532  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  51.2 
 
 		 580 aa  531  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  50.99 
 
 		 500 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.72 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.41 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.7 
 
 		 492 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  50.6 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.02 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.7 
 
 		 496 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.02 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  48.64 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.82 
 
 		 485 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  48.64 
 
 		 481 aa  475  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  48.09 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.8 
 
 		 478 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.51 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  48.9 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.72 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  48.43 
 
 		 481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.5 
 
 		 488 aa  465  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.67 
 
 		 489 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50 
 
 		 488 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  49.9 
 
 		 486 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  47.79 
 
 		 489 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  47.53 
 
 		 487 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  48.02 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  47.79 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  47.5 
 
 		 484 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  47.4 
 
 		 484 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  50.51 
 
 		 481 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  46.98 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  46.89 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  48.21 
 
 		 484 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  46.75 
 
 		 487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  46.99 
 
 		 490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  47.18 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.3 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  47.19 
 
 		 489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.15 
 
 		 482 aa  455  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  49.5 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  45.73 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.19 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  48.7 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  45.87 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  50.1 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  50.1 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  45.07 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  45.07 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 		 492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  49.49 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  47.02 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  48.43 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.91 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  49.3 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  46.69 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  45.67 
 
 		 488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  45.36 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  45.07 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  46.97 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  46.37 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  46.2 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  46.37 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  45.47 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.78 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  45.56 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  45.47 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  45.27 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0494  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0118721  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0507  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  47.17 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.45 
 
 		 485 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.07 
 
 		 495 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>