More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0494 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  81.11 
 
 
487 aa  851    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0494  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
487 aa  1014    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0118721  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0507  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
487 aa  1014    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  54.92 
 
 
493 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  54.3 
 
 
494 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.65 
 
 
494 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.05 
 
 
489 aa  463  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  47.95 
 
 
491 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.96 
 
 
506 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  47.85 
 
 
491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.46 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  46.72 
 
 
491 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.24 
 
 
493 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.24 
 
 
493 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  46.39 
 
 
580 aa  444  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  47.02 
 
 
2135 aa  436  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  47.13 
 
 
490 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  46.22 
 
 
491 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.99 
 
 
495 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  46.75 
 
 
492 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  45.59 
 
 
2126 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  45.23 
 
 
496 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.12 
 
 
493 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.66 
 
 
494 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  45.12 
 
 
495 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  45.29 
 
 
491 aa  428  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.12 
 
 
495 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  45.38 
 
 
491 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.92 
 
 
495 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  44.31 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  44.38 
 
 
494 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0947  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.14 
 
 
505 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  43.5 
 
 
481 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.06 
 
 
487 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.72 
 
 
484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  43.29 
 
 
481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.56 
 
 
484 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  42.54 
 
 
2126 aa  402  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  42.8 
 
 
492 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  43.76 
 
 
485 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.33 
 
 
495 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  42.57 
 
 
492 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  43.25 
 
 
492 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  42.26 
 
 
492 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  45.05 
 
 
492 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  42.57 
 
 
487 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  45.81 
 
 
489 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  44.31 
 
 
485 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  45.81 
 
 
489 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.18 
 
 
482 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  42.37 
 
 
488 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  41.4 
 
 
502 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  41.12 
 
 
491 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.91 
 
 
492 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.69 
 
 
488 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  42.2 
 
 
488 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  40.76 
 
 
488 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  41.87 
 
 
479 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  42.32 
 
 
481 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.12 
 
 
489 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.67 
 
 
471 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  43.4 
 
 
487 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  43.12 
 
 
488 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  42 
 
 
500 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  41.55 
 
 
489 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  42 
 
 
488 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.77 
 
 
496 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  40.37 
 
 
477 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.4 
 
 
495 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  43 
 
 
487 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  41.2 
 
 
488 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  41.55 
 
 
489 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  42 
 
 
487 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  43.03 
 
 
488 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  41.8 
 
 
488 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.47 
 
 
491 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  41.06 
 
 
472 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  39.67 
 
 
472 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  43.83 
 
 
486 aa  379  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  42.31 
 
 
489 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  40.95 
 
 
491 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  42.63 
 
 
505 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  43.23 
 
 
488 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  39.55 
 
 
477 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  43.42 
 
 
479 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  39.55 
 
 
477 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.51 
 
 
492 aa  374  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  40.64 
 
 
488 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  42.63 
 
 
488 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  42.23 
 
 
488 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  42.63 
 
 
488 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  42.63 
 
 
488 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  41.55 
 
 
486 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  42.36 
 
 
489 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  42.63 
 
 
488 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  44.1 
 
 
485 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  43.4 
 
 
487 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  42.63 
 
 
488 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  40.2 
 
 
480 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  40.36 
 
 
484 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.490935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>