More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1349 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  63.49 
 
 		 491 aa  634    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  62.07 
 
 		 490 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  64.71 
 
 		 491 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  65.11 
 
 		 491 aa  648    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  65.72 
 
 		 491 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 491 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  81.95 
 
 		 493 aa  860    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.23 
 
 		 489 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 		 493 aa  1018    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  65.11 
 
 		 491 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  71.86 
 
 		 461 aa  699    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  97.57 
 
 		 493 aa  1001    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  73.54 
 
 		 494 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  63.56 
 
 		 492 aa  634  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.78 
 
 		 495 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.37 
 
 		 495 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.37 
 
 		 495 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.17 
 
 		 495 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  59.27 
 
 		 494 aa  601  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  57.86 
 
 		 493 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.51 
 
 		 494 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  57.83 
 
 		 496 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0947  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.61 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.44 
 
 		 506 aa  581  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  52.6 
 
 		 2126 aa  540  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  54.77 
 
 		 2135 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  53.6 
 
 		 580 aa  531  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  50.71 
 
 		 2126 aa  514  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  50.69 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.61 
 
 		 484 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.22 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 		 480 aa  472  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.61 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  48.61 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.4 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.1 
 
 		 487 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  49.31 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  49.02 
 
 		 487 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.59 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  51 
 
 		 492 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.4 
 
 		 488 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  52.32 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  48.23 
 
 		 487 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  48.69 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.81 
 
 		 484 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.8 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  50.81 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  49.31 
 
 		 488 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  49.4 
 
 		 489 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  48.73 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.65 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  48.03 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  49.61 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  47.83 
 
 		 487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  47.84 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 		 484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  51.96 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  49.13 
 
 		 491 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  49.7 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  48.53 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  47.65 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  50.7 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  48.4 
 
 		 485 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  51.89 
 
 		 489 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  51.89 
 
 		 489 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  48.54 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.31 
 
 		 484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.12 
 
 		 488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  48.7 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  48.13 
 
 		 488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  48.13 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  48.92 
 
 		 487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  51.38 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  48.54 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  47.95 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0507  glutamate synthase subunit beta  47.24 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  49.3 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  48.71 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0494  glutamate synthase subunit beta  47.24 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0118721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  49.6 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.07 
 
 		 482 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.81 
 
 		 478 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.49 
 
 		 495 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  48.49 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  48.29 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.3 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  48.41 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  46.32 
 
 		 481 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  46.95 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.8 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  47.94 
 
 		 488 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  48.29 
 
 		 472 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1370  glutamate synthase subunit beta  51 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  47.94 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  47.64 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.39 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.21 
 
 		 495 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  46.89 
 
 		 490 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  48.37 
 
 		 479 aa  434  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  46.11 
 
 		 481 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>