More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0221 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 771 aa  1603    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.64 
 
 		 796 aa  724    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.21 
 
 		 771 aa  859    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 		 769 aa  658    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.49 
 
 		 776 aa  681    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  48.67 
 
 		 788 aa  775    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 797 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.76 
 
 		 758 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  37.77 
 
 		 768 aa  519  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.17 
 
 		 784 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  35.26 
 
 		 763 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.97 
 
 		 902 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  34.52 
 
 		 836 aa  475  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.92 
 
 		 802 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  27.91 
 
 		 423 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  27.53 
 
 		 392 aa  134  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  26.44 
 
 		 370 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  26.44 
 
 		 370 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  32.54 
 
 		 461 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  30.9 
 
 		 461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.19 
 
 		 411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.38 
 
 		 412 aa  127  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.45 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  27.32 
 
 		 347 aa  124  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  27.48 
 
 		 623 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  29.55 
 
 		 665 aa  119  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  29.84 
 
 		 256 aa  118  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.67 
 
 		 996 aa  118  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  35 
 
 		 615 aa  115  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2073  glutamate synthase, beta subunit, putative  35.11 
 
 		 439 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7262  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.82 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  34.08 
 
 		 470 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.88 
 
 		 466 aa  107  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.97 
 
 		 571 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.85 
 
 		 544 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  33.15 
 
 		 493 aa  106  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  33.52 
 
 		 1150 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  34.45 
 
 		 616 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.78 
 
 		 699 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.29 
 
 		 672 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.24 
 
 		 1487 aa  105  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  32.68 
 
 		 477 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.26 
 
 		 653 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  32.56 
 
 		 455 aa  104  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  33.03 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.21 
 
 		 609 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.5 
 
 		 578 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.16 
 
 		 1105 aa  103  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.51 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.62 
 
 		 672 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.65 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.81 
 
 		 458 aa  103  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  29.43 
 
 		 470 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.71 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  33.33 
 
 		 599 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.6 
 
 		 654 aa  102  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.97 
 
 		 546 aa  101  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.97 
 
 		 1440 aa  101  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  34.95 
 
 		 469 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  35.44 
 
 		 469 aa  101  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  32.8 
 
 		 597 aa  101  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.68 
 
 		 1440 aa  100  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.84 
 
 		 578 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2948  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain- containing protein  25.76 
 
 		 366 aa  99.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  33.8 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 1481 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  33.62 
 
 		 459 aa  99.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.87 
 
 		 559 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.81 
 
 		 543 aa  100  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.87 
 
 		 559 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  32.23 
 
 		 615 aa  99  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.87 
 
 		 558 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  34.29 
 
 		 465 aa  98.6  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  30.21 
 
 		 672 aa  98.6  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.98 
 
 		 578 aa  98.6  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.64 
 
 		 465 aa  98.6  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.7 
 
 		 464 aa  98.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.51 
 
 		 461 aa  98.2  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.97 
 
 		 658 aa  98.2  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 1406 aa  97.8  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.31 
 
 		 457 aa  98.2  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.39 
 
 		 1126 aa  98.2  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.2 
 
 		 579 aa  97.8  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  32.27 
 
 		 471 aa  97.8  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32 
 
 		 577 aa  97.8  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  32.26 
 
 		 469 aa  97.8  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.46 
 
 		 653 aa  97.4  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.07 
 
 		 1426 aa  97.4  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.25 
 
 		 656 aa  96.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  34.62 
 
 		 1073 aa  97.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  28.84 
 
 		 612 aa  97.1  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30 
 
 		 467 aa  96.3  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  34.02 
 
 		 483 aa  96.3  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.54 
 
 		 612 aa  96.3  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.55 
 
 		 480 aa  96.3  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.86 
 
 		 1425 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2118  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 615 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  32.88 
 
 		 468 aa  95.9  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.16 
 
 		 465 aa  95.9  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_131  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase protein  32.69 
 
 		 677 aa  95.1  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000174101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>