More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1736 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  63.55 
 
 		 615 aa  805    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  70.2 
 
 		 616 aa  911    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  57.12 
 
 		 612 aa  721    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  100 
 
 		 615 aa  1271    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  47.09 
 
 		 598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.32 
 
 		 1487 aa  277  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.47 
 
 		 464 aa  252  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.2 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  34.08 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.31 
 
 		 458 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  34.08 
 
 		 469 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  34.94 
 
 		 470 aa  240  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.79 
 
 		 466 aa  239  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.51 
 
 		 476 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  34.69 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.23 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.9 
 
 		 468 aa  236  6e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  34.76 
 
 		 471 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.69 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.53 
 
 		 895 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  34.3 
 
 		 469 aa  233  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  32.44 
 
 		 470 aa  230  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.91 
 
 		 663 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  34.76 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.89 
 
 		 891 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  34.62 
 
 		 468 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  35.42 
 
 		 1150 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31 
 
 		 914 aa  224  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.03 
 
 		 476 aa  224  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.76 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.69 
 
 		 761 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.48 
 
 		 652 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 438 aa  220  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2406  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.62 
 
 		 648 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0287125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.21 
 
 		 1126 aa  220  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  33.76 
 
 		 469 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.47 
 
 		 1481 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.47 
 
 		 464 aa  219  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.68 
 
 		 463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.47 
 
 		 555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  30.55 
 
 		 469 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.27 
 
 		 483 aa  217  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  33.76 
 
 		 455 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.08 
 
 		 465 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  32.99 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  32.56 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.26 
 
 		 653 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  35.38 
 
 		 463 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  31.33 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.02 
 
 		 654 aa  212  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.94 
 
 		 699 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  34.81 
 
 		 476 aa  210  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  34.17 
 
 		 476 aa  210  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.91 
 
 		 479 aa  210  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.59 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  31.29 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.4 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.68 
 
 		 612 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  30.47 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  30.41 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1835  putative oxidoreductase  30.06 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.35 
 
 		 469 aa  208  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  30.7 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.18 
 
 		 447 aa  207  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.84 
 
 		 448 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  30.2 
 
 		 468 aa  206  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  30.67 
 
 		 468 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.67 
 
 		 653 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.83 
 
 		 653 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  30.88 
 
 		 468 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.67 
 
 		 653 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  30.85 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1175  glutamate synthase subunit beta  31.37 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.73 
 
 		 466 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.89 
 
 		 614 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03318  glutamate synthase subunit beta  31.55 
 
 		 493 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  30.47 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.04 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.67 
 
 		 653 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1801  putative oxidoreductase  30.28 
 
 		 478 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.83 
 
 		 653 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.71 
 
 		 646 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.12 
 
 		 463 aa  203  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  31.6 
 
 		 482 aa  203  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  30.72 
 
 		 455 aa  203  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  30.66 
 
 		 468 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  30 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.29 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.41 
 
 		 658 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.19 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.16 
 
 		 653 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  30.47 
 
 		 468 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  33.67 
 
 		 1005 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4037  putative oxidoreductase  30.28 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.239048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  31.8 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1552  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.26 
 
 		 646 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  30.55 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  33.12 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  31.4 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>