More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0560 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
370 aa  740    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  98.65 
 
 
370 aa  728    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  27 
 
 
392 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  33.15 
 
 
423 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
769 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.94 
 
 
796 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.45 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.17 
 
 
411 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.86 
 
 
776 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  24.34 
 
 
665 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  31.82 
 
 
256 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  26.68 
 
 
623 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.44 
 
 
784 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  27.57 
 
 
768 aa  149  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  26.63 
 
 
347 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2948  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain- containing protein  23.77 
 
 
366 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 
771 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.93 
 
 
797 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  27.3 
 
 
763 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.46 
 
 
902 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  26.44 
 
 
771 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  23.88 
 
 
836 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.87 
 
 
802 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  25.13 
 
 
788 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1873  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.29 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.28 
 
 
758 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0903  hypothetical protein  23.29 
 
 
367 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1874  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.7 
 
 
377 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0641  iron-sulfur binding reductase  28.37 
 
 
330 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.34 
 
 
686 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0969  hypothetical protein  26.69 
 
 
233 aa  94  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000386053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.71 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  25.14 
 
 
661 aa  92.8  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.92 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  25 
 
 
661 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.73 
 
 
494 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  23.85 
 
 
663 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.83 
 
 
494 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.21 
 
 
494 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.78 
 
 
661 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.43 
 
 
714 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0717  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.82 
 
 
538 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.942612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  23.03 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  21.49 
 
 
661 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.54 
 
 
661 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.38 
 
 
722 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.91 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  25.08 
 
 
678 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1499  heterodisulfide reductase, subunit D  22.16 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0669416  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  22.09 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.85 
 
 
662 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.12 
 
 
737 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.84 
 
 
662 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  25.14 
 
 
654 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.73 
 
 
712 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  22.86 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.82 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  22.67 
 
 
661 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.14 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  22.96 
 
 
659 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  20.38 
 
 
671 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  20.71 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  22.35 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.35 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  19.82 
 
 
721 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.11 
 
 
426 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  21.59 
 
 
431 aa  72.8  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  19.59 
 
 
676 aa  72.8  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  21.73 
 
 
409 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  20 
 
 
713 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  21.85 
 
 
652 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.81 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  22.95 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3052  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.36 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0403  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  20.11 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.864832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  22.09 
 
 
658 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  21.01 
 
 
762 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  19.56 
 
 
774 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  20.95 
 
 
683 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.22 
 
 
679 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.16 
 
 
663 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.12 
 
 
699 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  20.82 
 
 
727 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.65 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.5 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.15 
 
 
758 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  19.69 
 
 
1033 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.46 
 
 
683 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0085  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  22.01 
 
 
489 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52676  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.81 
 
 
717 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.5 
 
 
1131 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  22.4 
 
 
655 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  22.6 
 
 
1042 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  20.12 
 
 
730 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  22.6 
 
 
1046 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.45 
 
 
694 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  22.6 
 
 
1046 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  20.33 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  20.53 
 
 
716 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  21.41 
 
 
1044 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>