More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1874 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1874  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
377 aa  775    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1873  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.48 
 
 
390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0903  hypothetical protein  42.31 
 
 
367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.2 
 
 
411 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.64 
 
 
412 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  32.04 
 
 
623 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  31.32 
 
 
665 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  32.3 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  29.86 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2948  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain- containing protein  28.24 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  26.59 
 
 
370 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  26.59 
 
 
370 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.22 
 
 
796 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.09 
 
 
776 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  25.8 
 
 
768 aa  92.8  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0641  iron-sulfur binding reductase  23.5 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  27.18 
 
 
763 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25 
 
 
383 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  25.33 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.68 
 
 
797 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.18 
 
 
383 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  23.46 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.15 
 
 
784 aa  86.3  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  25.35 
 
 
1015 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  25.14 
 
 
836 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  23.5 
 
 
671 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.93 
 
 
711 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  23.1 
 
 
711 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  24.02 
 
 
549 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  24.53 
 
 
1015 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.1 
 
 
711 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0554  hypothetical protein  24.33 
 
 
339 aa  79.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.59 
 
 
758 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  23.7 
 
 
663 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.26 
 
 
902 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  24.89 
 
 
423 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  22.95 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  25.42 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  23.32 
 
 
788 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  23.31 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  24.72 
 
 
712 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  22.51 
 
 
588 aa  73.2  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
769 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  25.82 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.52 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1316  hypothetical protein  25.14 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3863  hypothetical protein  25.54 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1222  hypothetical protein  22.78 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.08 
 
 
771 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  26.8 
 
 
730 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  25.69 
 
 
717 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  23.3 
 
 
661 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  25.27 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.74 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  22.41 
 
 
661 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  25 
 
 
771 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.66 
 
 
802 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  26.03 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  23.36 
 
 
658 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  23.23 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0980  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.51 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  23.95 
 
 
678 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.64 
 
 
699 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0403  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.32 
 
 
490 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.864832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0771  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.42 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0497692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.85 
 
 
663 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  22.35 
 
 
643 aa  67  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  23.27 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  26.67 
 
 
711 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  27.15 
 
 
710 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1993  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.77 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  22.13 
 
 
639 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.31 
 
 
694 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  23.82 
 
 
692 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3052  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.14 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.64 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.06 
 
 
494 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  24.9 
 
 
711 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.22 
 
 
714 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.25 
 
 
494 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.75 
 
 
494 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1652  hypothetical protein  26.11 
 
 
355 aa  64.3  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  22.28 
 
 
661 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  24.8 
 
 
711 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.76 
 
 
437 aa  63.2  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0013  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  22.13 
 
 
540 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  22.65 
 
 
423 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.94 
 
 
722 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5544  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.11 
 
 
267 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.73 
 
 
656 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  24.15 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  23.23 
 
 
416 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  20.94 
 
 
717 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.23 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1037  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.93 
 
 
432 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.106795  normal  0.550231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.45 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  21.07 
 
 
655 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.74 
 
 
661 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.71 
 
 
679 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.45 
 
 
661 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>