More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0013 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0013  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  100 
 
 		 540 aa  1113    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  37.3 
 
 		 375 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  34.89 
 
 		 372 aa  231  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.1 
 
 		 383 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 		 383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  25.69 
 
 		 661 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  25.85 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  26.3 
 
 		 588 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  26.68 
 
 		 1015 aa  130  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.13 
 
 		 664 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.26 
 
 		 658 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.96 
 
 		 658 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.13 
 
 		 664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  26.03 
 
 		 549 aa  128  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  25.55 
 
 		 655 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  26.68 
 
 		 692 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  26.03 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  23.06 
 
 		 659 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  25.58 
 
 		 643 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.37 
 
 		 387 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  28.93 
 
 		 617 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.8 
 
 		 679 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.48 
 
 		 683 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  25.29 
 
 		 716 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  24.58 
 
 		 678 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  26.25 
 
 		 703 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  24.12 
 
 		 699 aa  120  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  24.87 
 
 		 658 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  26.84 
 
 		 683 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  25 
 
 		 386 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  26.67 
 
 		 654 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  24.32 
 
 		 652 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.6 
 
 		 686 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  26.87 
 
 		 727 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.3 
 
 		 737 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  23.91 
 
 		 661 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  26.44 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  23.82 
 
 		 716 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  25.25 
 
 		 688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.23 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.07 
 
 		 717 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.04 
 
 		 656 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  27.49 
 
 		 356 aa  114  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.46 
 
 		 662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  27.79 
 
 		 661 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  25.9 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.31 
 
 		 656 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0470  hypothetical protein  25.6 
 
 		 361 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.42 
 
 		 494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.46 
 
 		 662 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.58 
 
 		 722 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  25.93 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.69 
 
 		 655 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  25.07 
 
 		 683 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.98 
 
 		 676 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.26 
 
 		 661 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.94 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  25.5 
 
 		 720 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.92 
 
 		 723 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  25.94 
 
 		 739 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.62 
 
 		 713 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  26.67 
 
 		 671 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.65 
 
 		 714 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1024 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1033 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.16 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.23 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  23.37 
 
 		 1388 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.45 
 
 		 748 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.26 
 
 		 774 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1015 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.84 
 
 		 694 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  27.1 
 
 		 615 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  24.16 
 
 		 390 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  23.84 
 
 		 678 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0865  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  34.42 
 
 		 166 aa  104  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1024 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.65 
 
 		 721 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  25 
 
 		 743 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  24.34 
 
 		 661 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.76 
 
 		 661 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  24.43 
 
 		 732 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0148  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  33.12 
 
 		 161 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3584  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  37.3 
 
 		 188 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.57 
 
 		 663 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  24.62 
 
 		 661 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  23.79 
 
 		 762 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4582  hypothetical protein  27.76 
 
 		 263 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  26.11 
 
 		 662 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.55 
 
 		 699 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4016  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.89 
 
 		 265 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  23.76 
 
 		 718 aa  100  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  22.34 
 
 		 703 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  22.34 
 
 		 703 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.86 
 
 		 629 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.85 
 
 		 712 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.4 
 
 		 711 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  23.41 
 
 		 711 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  22.34 
 
 		 629 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  22.34 
 
 		 703 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>