250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02676 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  534  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  38.8 
 
 
423 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  32.23 
 
 
370 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  31.82 
 
 
370 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.2 
 
 
796 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.48 
 
 
784 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.98 
 
 
776 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 
769 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  31.82 
 
 
392 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  29.68 
 
 
763 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.64 
 
 
771 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.64 
 
 
412 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
758 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.38 
 
 
797 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.25 
 
 
411 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  29.84 
 
 
771 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.59 
 
 
623 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.19 
 
 
802 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  25.38 
 
 
788 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  27.98 
 
 
665 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  28.92 
 
 
347 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  31.02 
 
 
768 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  25.1 
 
 
836 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2948  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain- containing protein  26.48 
 
 
366 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.23 
 
 
902 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1873  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.78 
 
 
390 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1874  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.33 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0903  hypothetical protein  24.63 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0969  hypothetical protein  24.66 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000386053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.03 
 
 
721 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3863  hypothetical protein  25.31 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0641  iron-sulfur binding reductase  23.04 
 
 
330 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  29.78 
 
 
549 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  29.65 
 
 
494 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.84 
 
 
494 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.89 
 
 
406 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1167  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.9 
 
 
404 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.4 
 
 
686 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.72 
 
 
418 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  24.88 
 
 
388 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.22 
 
 
658 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.36 
 
 
494 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.71 
 
 
694 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.18 
 
 
414 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.36 
 
 
494 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.62 
 
 
699 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  23.44 
 
 
716 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.79 
 
 
414 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.01 
 
 
406 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  25.54 
 
 
661 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.89 
 
 
406 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.3 
 
 
737 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  24.8 
 
 
711 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  27.62 
 
 
639 aa  53.1  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11058  putative iron-sulfur-binding reductase  27.92 
 
 
262 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  28.3 
 
 
588 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  27.5 
 
 
1279 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  27.66 
 
 
481 aa  52.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5544  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.39 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.38 
 
 
658 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  25.11 
 
 
717 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
1342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
1342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
1342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
1342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  27 
 
 
1279 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  25 
 
 
643 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  24.23 
 
 
711 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2146  hypothetical protein  34.95 
 
 
441 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.67 
 
 
694 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
1342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  24.38 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
1342 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
1342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  26.87 
 
 
1364 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.36 
 
 
1344 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  26 
 
 
1349 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  25.68 
 
 
1015 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 
1371 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  22.49 
 
 
661 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.27 
 
 
661 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  25.65 
 
 
711 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  26.24 
 
 
1359 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.7 
 
 
1282 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  22.95 
 
 
683 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.42 
 
 
434 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  25.47 
 
 
1308 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  23.94 
 
 
409 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  27.16 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  26.87 
 
 
1341 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  23.3 
 
 
663 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.87 
 
 
1340 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.87 
 
 
1340 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.55 
 
 
656 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  28.57 
 
 
259 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  24.56 
 
 
730 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  26.73 
 
 
1308 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2911  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.67 
 
 
339 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  26.87 
 
 
1341 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.87 
 
 
1341 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>