More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0843 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
418 aa  860    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1167  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.11 
 
 
404 aa  416  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  31.9 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  32.46 
 
 
421 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.12 
 
 
426 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.38 
 
 
426 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  31.1 
 
 
421 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  31.19 
 
 
428 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.12 
 
 
428 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  30 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.09 
 
 
434 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  28.84 
 
 
442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  29.15 
 
 
442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  28.84 
 
 
442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.84 
 
 
442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  29.15 
 
 
442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  28.04 
 
 
423 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.67 
 
 
442 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  28.87 
 
 
730 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  29.31 
 
 
442 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.61 
 
 
442 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.91 
 
 
442 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.91 
 
 
442 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.45 
 
 
429 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3240  iron-sulfur cluster-binding protein  28.41 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.730489  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.1 
 
 
433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  30.75 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.95 
 
 
411 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  27.49 
 
 
430 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  29.38 
 
 
442 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  26.95 
 
 
423 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  28.57 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  28.04 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1863  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
430 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  26.76 
 
 
413 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.85 
 
 
413 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0345  hypothetical protein  27.38 
 
 
431 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268241  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  27.61 
 
 
711 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.32 
 
 
413 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.67 
 
 
442 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1222  hypothetical protein  25.93 
 
 
432 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.27 
 
 
447 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  27.6 
 
 
711 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  26.64 
 
 
712 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1037  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.64 
 
 
432 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.106795  normal  0.550231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  27.79 
 
 
441 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  26.78 
 
 
445 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  27.61 
 
 
711 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.15 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  26.89 
 
 
717 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  28.28 
 
 
435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0393  hypothetical protein  23.77 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.544976  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  25.25 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.38 
 
 
425 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.97 
 
 
465 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.08 
 
 
414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.4 
 
 
414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  26.49 
 
 
450 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  27.86 
 
 
416 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.18 
 
 
452 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1993  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.37 
 
 
431 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  27.25 
 
 
494 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.62 
 
 
447 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.65 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  26.13 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.14 
 
 
447 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.78 
 
 
722 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.65 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.97 
 
 
708 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.29 
 
 
494 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.87 
 
 
494 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  28.21 
 
 
717 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.87 
 
 
494 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0385  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.25 
 
 
420 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.31 
 
 
438 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0339  hypothetical protein  25 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  27.55 
 
 
714 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  27.67 
 
 
453 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.06 
 
 
438 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  27.36 
 
 
425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.78 
 
 
420 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  26.77 
 
 
716 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  26.21 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  25.06 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  26.62 
 
 
507 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0717  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  29.64 
 
 
538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.942612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2792  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.61 
 
 
417 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000832381  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  24.19 
 
 
767 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1616  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.99 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.63 
 
 
445 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1221  hypothetical protein  27.39 
 
 
385 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.339295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  23.65 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  23.75 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  24.78 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.59 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  26.39 
 
 
710 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  25.56 
 
 
438 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  25.17 
 
 
474 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  26.13 
 
 
716 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>