More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2474 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  53.88 
 
 
1044 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  58.09 
 
 
739 aa  856    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  57.68 
 
 
716 aa  839    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  56.75 
 
 
717 aa  826    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
721 aa  1476    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.93 
 
 
762 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  49.86 
 
 
716 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  51.26 
 
 
718 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  58.63 
 
 
743 aa  861    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.1 
 
 
737 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.67 
 
 
758 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  54.61 
 
 
1046 aa  808    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  57.95 
 
 
699 aa  844    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  54.61 
 
 
1042 aa  809    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  51.55 
 
 
732 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.12 
 
 
676 aa  693    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  49.72 
 
 
737 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.52 
 
 
748 aa  689    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  56.09 
 
 
882 aa  822    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  50.63 
 
 
683 aa  672    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  49.44 
 
 
762 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  54.25 
 
 
1033 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  54.61 
 
 
1046 aa  808    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  53.31 
 
 
1027 aa  796    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  47.37 
 
 
727 aa  632  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  45.05 
 
 
1388 aa  607  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.44 
 
 
1215 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.53 
 
 
1131 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.28 
 
 
774 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.2 
 
 
711 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.7 
 
 
711 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  39.86 
 
 
711 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  39.75 
 
 
678 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  38.57 
 
 
703 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  38.42 
 
 
703 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  38.33 
 
 
703 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  38.42 
 
 
703 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  38.28 
 
 
703 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  38.42 
 
 
703 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  38.42 
 
 
703 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.39 
 
 
699 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  37.48 
 
 
703 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  38.29 
 
 
703 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  38.15 
 
 
703 aa  459  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.45 
 
 
698 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.43 
 
 
722 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  38.98 
 
 
629 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.95 
 
 
713 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.59 
 
 
683 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  36.11 
 
 
727 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  35.7 
 
 
678 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.54 
 
 
686 aa  419  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  35.13 
 
 
752 aa  416  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.05 
 
 
699 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.91 
 
 
694 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  37.95 
 
 
683 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  35.17 
 
 
730 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  36.13 
 
 
659 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  35.24 
 
 
652 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.21 
 
 
655 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.43 
 
 
694 aa  399  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  36.6 
 
 
658 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.86 
 
 
656 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.64 
 
 
658 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.66 
 
 
679 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.78 
 
 
989 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  34.97 
 
 
714 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  33.38 
 
 
661 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  36.12 
 
 
655 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.68 
 
 
658 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.62 
 
 
656 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.45 
 
 
664 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.12 
 
 
664 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.57 
 
 
663 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  35.58 
 
 
661 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.38 
 
 
663 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.39 
 
 
712 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.15 
 
 
641 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.1 
 
 
661 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  32.2 
 
 
661 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  33.14 
 
 
663 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  32.54 
 
 
671 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  32.14 
 
 
661 aa  340  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.85 
 
 
714 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.64 
 
 
722 aa  337  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.01 
 
 
662 aa  337  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.67 
 
 
661 aa  336  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  30.97 
 
 
688 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.26 
 
 
662 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.12 
 
 
723 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  31.12 
 
 
661 aa  316  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  33.91 
 
 
720 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  31.56 
 
 
720 aa  312  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  30.37 
 
 
703 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.71 
 
 
629 aa  294  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  35.4 
 
 
654 aa  293  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  30.24 
 
 
662 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  30.5 
 
 
692 aa  290  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0501  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.46 
 
 
724 aa  287  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.17587  normal  0.555543 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  35.73 
 
 
643 aa  280  7e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>