More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5959 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  59.17 
 
 
720 aa  871    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  100 
 
 
720 aa  1487    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.26 
 
 
723 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3824  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.43 
 
 
728 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.676113  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0042  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.18 
 
 
738 aa  492  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1707  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.91 
 
 
737 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0933  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.83 
 
 
695 aa  478  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271519  normal  0.676616 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0501  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.3 
 
 
724 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.17587  normal  0.555543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.87 
 
 
662 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.69 
 
 
713 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.34 
 
 
662 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  35.05 
 
 
730 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  35.1 
 
 
727 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  35.83 
 
 
661 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  36.21 
 
 
663 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  33.86 
 
 
671 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  34.24 
 
 
661 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  30.75 
 
 
752 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.48 
 
 
661 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.81 
 
 
661 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  33.53 
 
 
661 aa  362  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.65 
 
 
699 aa  360  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.08 
 
 
698 aa  360  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.47 
 
 
714 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.29 
 
 
722 aa  355  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.54 
 
 
694 aa  352  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.01 
 
 
686 aa  349  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.14 
 
 
722 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.05 
 
 
694 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  34.01 
 
 
662 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.69 
 
 
699 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  31.17 
 
 
659 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  28.98 
 
 
703 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  28.98 
 
 
703 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  28.98 
 
 
703 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  28.98 
 
 
703 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  28.98 
 
 
703 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  28.98 
 
 
703 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.57 
 
 
989 aa  324  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  28.98 
 
 
703 aa  324  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  28.71 
 
 
703 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  28.98 
 
 
703 aa  321  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  29.59 
 
 
703 aa  321  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  32.34 
 
 
629 aa  317  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  30.88 
 
 
688 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  33 
 
 
692 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.85 
 
 
711 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.97 
 
 
679 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  30.25 
 
 
658 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  32.08 
 
 
714 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  29.43 
 
 
661 aa  308  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  32.99 
 
 
711 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  32.66 
 
 
652 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  30.78 
 
 
683 aa  303  6.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.5 
 
 
711 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  32.27 
 
 
678 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  36.48 
 
 
655 aa  300  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.58 
 
 
656 aa  300  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.56 
 
 
721 aa  298  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  30.68 
 
 
739 aa  296  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  30.76 
 
 
661 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.94 
 
 
717 aa  296  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.92 
 
 
656 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.69 
 
 
762 aa  295  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  30.02 
 
 
718 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.2 
 
 
743 aa  292  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  35.11 
 
 
699 aa  292  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.08 
 
 
663 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  35.87 
 
 
703 aa  291  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.73 
 
 
676 aa  291  4e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.03 
 
 
664 aa  290  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  31.19 
 
 
716 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  29.67 
 
 
732 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.65 
 
 
664 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.92 
 
 
737 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  35.32 
 
 
1033 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.47 
 
 
663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.08 
 
 
683 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  31.04 
 
 
727 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  38.03 
 
 
1388 aa  282  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.21 
 
 
658 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  29.1 
 
 
678 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.56 
 
 
658 aa  280  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.33 
 
 
758 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  33.86 
 
 
716 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  36.17 
 
 
615 aa  275  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  33.48 
 
 
683 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.89 
 
 
737 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  36.79 
 
 
762 aa  271  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.9 
 
 
774 aa  267  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.48 
 
 
748 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.41 
 
 
655 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.25 
 
 
629 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0397  iron-sulfur cluster-binding protein  37.53 
 
 
669 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0494  hypothetical protein  34.91 
 
 
653 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.71 
 
 
437 aa  262  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5222  hypothetical protein  34.91 
 
 
649 aa  262  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064431  hitchhiker  0.00288183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6186  putative ferredoxin  34.48 
 
 
658 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71280  putative ferredoxin  34.62 
 
 
653 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.960702  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3745  hypothetical protein  36.41 
 
 
633 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0847485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>