More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1502 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  61.88 
 
 		 661 aa  842    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  97.44 
 
 		 664 aa  1318    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  64.98 
 
 		 659 aa  900    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  61.97 
 
 		 658 aa  880    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  64.3 
 
 		 655 aa  872    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  64.46 
 
 		 658 aa  865    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  67.73 
 
 		 661 aa  962    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  64.31 
 
 		 658 aa  869    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.82 
 
 		 656 aa  817    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.14 
 
 		 655 aa  779    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.52 
 
 		 656 aa  817    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  60.12 
 
 		 663 aa  811    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  58.82 
 
 		 663 aa  801    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  64.8 
 
 		 652 aa  904    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 		 664 aa  1370    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  40.68 
 
 		 711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.54 
 
 		 711 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.97 
 
 		 711 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.95 
 
 		 699 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  39.65 
 
 		 678 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  36.13 
 
 		 678 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.7 
 
 		 683 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.79 
 
 		 712 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.8 
 
 		 698 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.69 
 
 		 694 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.02 
 
 		 699 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.71 
 
 		 694 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  37.29 
 
 		 1033 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  34.78 
 
 		 703 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  34.35 
 
 		 703 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  34.35 
 
 		 703 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  34.35 
 
 		 703 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  34.83 
 
 		 703 aa  432  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  34.35 
 
 		 703 aa  429  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  34.35 
 
 		 703 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  34.35 
 
 		 703 aa  429  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  34.35 
 
 		 703 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  34.2 
 
 		 703 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.2 
 
 		 686 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.68 
 
 		 676 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  35.68 
 
 		 716 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.77 
 
 		 722 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  35.16 
 
 		 629 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  35.8 
 
 		 671 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  34.84 
 
 		 661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.48 
 
 		 717 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.68 
 
 		 679 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  35.3 
 
 		 699 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.72 
 
 		 737 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  36.35 
 
 		 661 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  35.74 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  36.14 
 
 		 716 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  38.17 
 
 		 683 aa  398  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  36.4 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  36.58 
 
 		 882 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  36.12 
 
 		 718 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  34.93 
 
 		 727 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.25 
 
 		 762 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  35 
 
 		 661 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  35.66 
 
 		 663 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.62 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  35.01 
 
 		 1044 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  35.95 
 
 		 1046 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1042 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1046 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1027 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.45 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  33.78 
 
 		 739 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.98 
 
 		 743 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.28 
 
 		 721 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.34 
 
 		 722 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  35.51 
 
 		 683 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.04 
 
 		 662 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.49 
 
 		 662 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.89 
 
 		 714 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.92 
 
 		 758 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.76 
 
 		 748 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  34.19 
 
 		 662 aa  363  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  31.99 
 
 		 727 aa  361  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  33.9 
 
 		 762 aa  360  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.04 
 
 		 641 aa  359  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  34.32 
 
 		 1388 aa  359  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.1 
 
 		 737 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  32.5 
 
 		 692 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  32.02 
 
 		 730 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.65 
 
 		 1131 aa  352  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  34.32 
 
 		 703 aa  352  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.38 
 
 		 989 aa  352  2e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  31.86 
 
 		 688 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.95 
 
 		 713 aa  350  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.16 
 
 		 774 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.64 
 
 		 1215 aa  339  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  33.19 
 
 		 654 aa  332  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  28.69 
 
 		 752 aa  327  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3824  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.1 
 
 		 728 aa  324  4e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.676113  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.83 
 
 		 723 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0042  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.16 
 
 		 738 aa  313  4.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0501  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.46 
 
 		 724 aa  313  9e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.17587  normal  0.555543 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1707  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.95 
 
 		 737 aa  307  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121804  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  31.01 
 
 		 720 aa  300  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0717248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>