More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1499 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1499  heterodisulfide reductase, subunit D  100 
 
 
382 aa  783    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0669416  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.78 
 
 
383 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.22 
 
 
383 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  29.59 
 
 
409 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0980  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.45 
 
 
440 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0952  hypothetical protein  32.94 
 
 
365 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.48 
 
 
387 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  29.17 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  30.18 
 
 
415 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.21 
 
 
722 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  31.25 
 
 
388 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  28.94 
 
 
1015 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  31.4 
 
 
1033 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  30.75 
 
 
727 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2003  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.48 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0747762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  28.42 
 
 
375 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.53 
 
 
717 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.74 
 
 
686 aa  132  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  29.89 
 
 
730 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0771  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.04 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0497692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  27.72 
 
 
658 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  26.9 
 
 
716 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.02 
 
 
385 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.09 
 
 
713 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.48 
 
 
748 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  30.7 
 
 
752 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  29.34 
 
 
1388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  28.88 
 
 
678 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.98 
 
 
737 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.11 
 
 
414 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  27.12 
 
 
390 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.3 
 
 
683 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.28 
 
 
656 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.02 
 
 
656 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.45 
 
 
762 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  25.79 
 
 
717 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.01 
 
 
721 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11058  putative iron-sulfur-binding reductase  32.37 
 
 
262 aa  122  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  26.45 
 
 
678 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  27.54 
 
 
699 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  26.12 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.89 
 
 
641 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  26.41 
 
 
1015 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  24.48 
 
 
1024 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  28.53 
 
 
655 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  31.1 
 
 
356 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.31 
 
 
722 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0123  Fe-S oxidoreductase, dehydrogenase subunit  31.43 
 
 
262 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4016  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.92 
 
 
265 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4582  hypothetical protein  32.51 
 
 
263 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  31.07 
 
 
720 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.56 
 
 
694 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  27.83 
 
 
739 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  29.54 
 
 
654 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5887  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.12 
 
 
259 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.06 
 
 
434 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.75 
 
 
712 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.76 
 
 
655 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.92 
 
 
699 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  25.2 
 
 
1024 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.16 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0085  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.4 
 
 
489 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52676  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  25.12 
 
 
716 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.58 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.58 
 
 
426 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  24.16 
 
 
423 aa  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1222  hypothetical protein  27.11 
 
 
432 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  28.61 
 
 
652 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.85 
 
 
658 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  27.59 
 
 
683 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5544  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.16 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  23.82 
 
 
730 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.62 
 
 
676 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  28.27 
 
 
727 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.43 
 
 
658 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.72 
 
 
743 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1652  hypothetical protein  30 
 
 
355 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.64 
 
 
663 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  23.7 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0507  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.25 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.757481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.37 
 
 
694 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.85 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.11 
 
 
414 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  24.29 
 
 
421 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0746  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.39 
 
 
266 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30347  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  27.32 
 
 
688 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  24.94 
 
 
711 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  29.24 
 
 
718 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.15 
 
 
1131 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  28.95 
 
 
732 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  25.45 
 
 
629 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  28.57 
 
 
762 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  29.08 
 
 
703 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  29.08 
 
 
703 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  29.08 
 
 
703 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  25.96 
 
 
643 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  29.08 
 
 
703 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  29.08 
 
 
703 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  29.08 
 
 
703 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  29.76 
 
 
703 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>