160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1414 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  55.46 
 
 		 560 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  54.38 
 
 		 559 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  55.12 
 
 		 560 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  68.22 
 
 		 570 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  65.95 
 
 		 572 aa  713    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  59.02 
 
 		 576 aa  648    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  55.1 
 
 		 560 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  66.85 
 
 		 566 aa  742    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  100 
 
 		 565 aa  1152    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  57.44 
 
 		 580 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  57.96 
 
 		 578 aa  648    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  55.1 
 
 		 560 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  54.92 
 
 		 560 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  54.64 
 
 		 544 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  53.27 
 
 		 556 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  38.42 
 
 		 623 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  33.69 
 
 		 649 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  32.16 
 
 		 563 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  30.02 
 
 		 557 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  29.83 
 
 		 723 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  29.1 
 
 		 575 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  30.05 
 
 		 562 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  25.19 
 
 		 564 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.88 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  25.05 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.46 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.4 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.65 
 
 		 485 aa  94.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.25 
 
 		 490 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.25 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.65 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.65 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.44 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.65 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.45 
 
 		 482 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  24.7 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  25 
 
 		 490 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.04 
 
 		 487 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.97 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  23.72 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  23.72 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  22.63 
 
 		 803 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  23.66 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  23.06 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  27.78 
 
 		 478 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  27.78 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  27.78 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  28.33 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  28.33 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  22.47 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  27.78 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  27.22 
 
 		 478 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  26.29 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  26.26 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  34.74 
 
 		 573 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  27.59 
 
 		 624 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  41.57 
 
 		 503 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  21.42 
 
 		 541 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  42.47 
 
 		 496 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  55.1 
 
 		 469 aa  53.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  24.51 
 
 		 531 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  40.28 
 
 		 480 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  24.46 
 
 		 707 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  39.33 
 
 		 419 aa  51.2  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  28.74 
 
 		 698 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  56.52 
 
 		 644 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  22.22 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  27.93 
 
 		 565 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  36 
 
 		 519 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  38.75 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  32.97 
 
 		 157 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  34 
 
 		 528 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  30.91 
 
 		 507 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  43.84 
 
 		 580 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  35.29 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  37.5 
 
 		 638 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  35.8 
 
 		 418 aa  47.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  39.74 
 
 		 350 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  41.38 
 
 		 498 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 647 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  32.14 
 
 		 359 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  37.14 
 
 		 500 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  28.45 
 
 		 685 aa  47  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  49.02 
 
 		 570 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  48 
 
 		 577 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  34.57 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  37.97 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  35.8 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  46 
 
 		 578 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  40 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  35.82 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  48.98 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 435 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  54.76 
 
 		 594 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  48.28 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  54.76 
 
 		 594 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  54.76 
 
 		 594 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  53.19 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  38.1 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>