105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4256 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  324  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  72.44 
 
 		 644 aa  243  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  43.01 
 
 		 562 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  40.86 
 
 		 557 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  43.48 
 
 		 575 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  41.49 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  38.54 
 
 		 623 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  37.63 
 
 		 723 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  31.91 
 
 		 560 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  40.96 
 
 		 698 aa  50.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  40.51 
 
 		 503 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  31.91 
 
 		 560 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  35.56 
 
 		 523 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  31.91 
 
 		 560 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  46.25 
 
 		 478 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  31.91 
 
 		 560 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  42.67 
 
 		 491 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  31.96 
 
 		 580 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  30.85 
 
 		 544 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  34.31 
 
 		 527 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  30.85 
 
 		 559 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  29.67 
 
 		 566 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  32.97 
 
 		 565 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  33.33 
 
 		 572 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  47.17 
 
 		 492 aa  47.4  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  32.73 
 
 		 495 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  33.33 
 
 		 527 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  38.96 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  29.79 
 
 		 560 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  40 
 
 		 527 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  35.05 
 
 		 564 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  29.67 
 
 		 570 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  37.14 
 
 		 532 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  30.67 
 
 		 529 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  44.9 
 
 		 498 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  37.18 
 
 		 646 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  44.9 
 
 		 498 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  36.36 
 
 		 478 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  36.36 
 
 		 478 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  41.18 
 
 		 457 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  36.47 
 
 		 573 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  35 
 
 		 496 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  48.78 
 
 		 498 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  37.66 
 
 		 478 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  48.44 
 
 		 478 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 		 494 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  41.82 
 
 		 520 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  45.65 
 
 		 493 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  41.38 
 
 		 493 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  47.92 
 
 		 578 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  42.65 
 
 		 469 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  30.11 
 
 		 576 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  41.38 
 
 		 493 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  55 
 
 		 644 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  41.38 
 
 		 493 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  47.92 
 
 		 494 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  27.66 
 
 		 578 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  31.82 
 
 		 459 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  44.44 
 
 		 536 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  35.9 
 
 		 478 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  51.35 
 
 		 492 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  47.83 
 
 		 454 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  34 
 
 		 447 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  37.31 
 
 		 532 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  35.9 
 
 		 478 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  35.9 
 
 		 478 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  35.9 
 
 		 478 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  35.9 
 
 		 478 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  37.65 
 
 		 445 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  43.75 
 
 		 492 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  33.33 
 
 		 496 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  35.44 
 
 		 507 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  35.9 
 
 		 478 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  32.38 
 
 		 537 aa  42.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 483 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  44.62 
 
 		 456 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  35.94 
 
 		 435 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  46.81 
 
 		 536 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  36.92 
 
 		 492 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 351 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0415  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 		 556 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.291611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  31.43 
 
 		 416 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  50 
 
 		 463 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  33.33 
 
 		 378 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  41.94 
 
 		 450 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 		 529 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  41.94 
 
 		 450 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 428 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 424 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  42.42 
 
 		 419 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  42.86 
 
 		 456 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.83 
 
 		 422 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.815625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  47.5 
 
 		 490 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 436 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67150  putative oxidoreductase  46.81 
 
 		 416 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54131  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  32.1 
 
 		 685 aa  40.8  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 		 428 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  45.95 
 
 		 493 aa  40.8  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5823  putative oxidoreductase  46.81 
 
 		 416 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  45 
 
 		 494 aa  40.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>