123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3618 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  57.14 
 
 		 560 aa  688    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  56.81 
 
 		 544 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  56.81 
 
 		 559 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  57.68 
 
 		 560 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  68.22 
 
 		 565 aa  766    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  62.25 
 
 		 576 aa  699    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  100 
 
 		 570 aa  1170    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  56.96 
 
 		 560 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  60.8 
 
 		 580 aa  701    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  56.43 
 
 		 560 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  56.61 
 
 		 560 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  65.98 
 
 		 572 aa  746    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  70.16 
 
 		 566 aa  786    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  62.21 
 
 		 578 aa  706    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  57.96 
 
 		 556 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  38.74 
 
 		 623 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  37.4 
 
 		 649 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  30.78 
 
 		 563 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  29.31 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  29.03 
 
 		 562 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  26.83 
 
 		 575 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  28.7 
 
 		 723 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.65 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.99 
 
 		 485 aa  113  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.75 
 
 		 487 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.14 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.14 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.99 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.94 
 
 		 482 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.14 
 
 		 487 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.69 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.99 
 
 		 487 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.9 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  22.51 
 
 		 564 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.99 
 
 		 523 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.19 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  23.46 
 
 		 478 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  23.86 
 
 		 644 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  23.89 
 
 		 803 aa  87.4  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  21.56 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  28.89 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.19 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  28.33 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  28.33 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  28.89 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  28.33 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  28.33 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  28.74 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  28.74 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  23.57 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  28.49 
 
 		 478 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  22.6 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  27.5 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  25.65 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  24.21 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  34.41 
 
 		 573 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  23.82 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.4 
 
 		 456 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  32.79 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  42.31 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  24.03 
 
 		 526 aa  55.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  37.35 
 
 		 457 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  26.34 
 
 		 421 aa  53.9  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  27.37 
 
 		 519 aa  53.5  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  40.24 
 
 		 456 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  30.46 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  21.25 
 
 		 516 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  32.03 
 
 		 532 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  36.13 
 
 		 419 aa  51.2  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  24.18 
 
 		 464 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  40 
 
 		 698 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  41.1 
 
 		 685 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  36.25 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  21.76 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  35.71 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  22.54 
 
 		 707 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  38.75 
 
 		 350 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  41.1 
 
 		 638 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  58.54 
 
 		 439 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  33.86 
 
 		 452 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  37.35 
 
 		 408 aa  47  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  36.25 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  38.27 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  36.25 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  25.45 
 
 		 446 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  54.35 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  27.53 
 
 		 530 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 510 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  40 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  23.37 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  37.5 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  28.19 
 
 		 514 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  26.35 
 
 		 507 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.17 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  29.67 
 
 		 157 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  51.06 
 
 		 580 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  35 
 
 		 378 aa  45.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.61 
 
 		 496 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  48.33 
 
 		 473 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>