89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1186 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  60.94 
 
 
560 aa  732    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  62.21 
 
 
570 aa  706    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  57.96 
 
 
565 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  60.99 
 
 
566 aa  692    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  60.62 
 
 
572 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  100 
 
 
578 aa  1181    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  60.58 
 
 
560 aa  729    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  60.4 
 
 
560 aa  731    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  67.76 
 
 
580 aa  793    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  61.12 
 
 
560 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  88.21 
 
 
576 aa  1036    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  60.76 
 
 
560 aa  733    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  60.76 
 
 
559 aa  730    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  60.52 
 
 
544 aa  716    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  58.15 
 
 
556 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  38.78 
 
 
623 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  35.11 
 
 
649 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  31.44 
 
 
563 aa  226  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  30.94 
 
 
557 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  30.45 
 
 
562 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  30.34 
 
 
723 aa  206  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  29.95 
 
 
575 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.57 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  23.04 
 
 
564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  23.31 
 
 
644 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.63 
 
 
523 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  26.26 
 
 
803 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.99 
 
 
487 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.1 
 
 
487 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.5 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.84 
 
 
490 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.95 
 
 
482 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.95 
 
 
487 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.95 
 
 
482 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.1 
 
 
482 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.71 
 
 
490 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.29 
 
 
490 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.09 
 
 
482 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.05 
 
 
478 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 
478 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  24.49 
 
 
572 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  24.61 
 
 
491 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  22.66 
 
 
573 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  30.32 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  29.44 
 
 
478 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  28.89 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  29.44 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  29.44 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  28.89 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  29.44 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  30.73 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  29.74 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  21.64 
 
 
541 aa  67.4  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  31.84 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  46.07 
 
 
503 aa  67  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  22.1 
 
 
537 aa  61.2  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  21.62 
 
 
527 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  25.56 
 
 
624 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  24.94 
 
 
628 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  21.8 
 
 
533 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  24.13 
 
 
531 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  44.62 
 
 
524 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  22.18 
 
 
533 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  27.32 
 
 
519 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  36.14 
 
 
332 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  40.74 
 
 
456 aa  48.9  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  37.8 
 
 
557 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  36.14 
 
 
355 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  41.25 
 
 
408 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  22.44 
 
 
535 aa  47.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  23.4 
 
 
526 aa  47.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  34.02 
 
 
527 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  40.23 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  31.67 
 
 
528 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  24.25 
 
 
465 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  36.59 
 
 
408 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 
407 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  34 
 
 
367 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  31.73 
 
 
532 aa  44.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  45.61 
 
 
480 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  36.76 
 
 
421 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  36.84 
 
 
456 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  29.08 
 
 
448 aa  44.3  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  37.97 
 
 
496 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 
350 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  38.96 
 
 
350 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1491  hypothetical protein  38.24 
 
 
587 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.287152  normal  0.0494428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  27.66 
 
 
157 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  37.1 
 
 
698 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>