179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1152 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  100 
 
 
533 aa  1120    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  81.05 
 
 
533 aa  952    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  95.9 
 
 
537 aa  1082    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  76.13 
 
 
532 aa  870    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  53.41 
 
 
535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  51.35 
 
 
519 aa  552  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  50.96 
 
 
530 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  49.81 
 
 
541 aa  539  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  48.38 
 
 
526 aa  534  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  39.58 
 
 
528 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  39.47 
 
 
527 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  38.26 
 
 
516 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  38.26 
 
 
516 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  38.75 
 
 
524 aa  349  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  34.35 
 
 
529 aa  307  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  36.33 
 
 
531 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  36.8 
 
 
531 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  36.57 
 
 
536 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  35.84 
 
 
520 aa  272  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  32.21 
 
 
527 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  32.83 
 
 
527 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  34.57 
 
 
535 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  31.33 
 
 
507 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  30.81 
 
 
557 aa  232  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  27.37 
 
 
638 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  30.29 
 
 
478 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.88 
 
 
492 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  27.63 
 
 
646 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  31.11 
 
 
491 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  29.84 
 
 
478 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  28.81 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  28.81 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  27.4 
 
 
478 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  26.83 
 
 
478 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  27.2 
 
 
478 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  26.99 
 
 
478 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  27.05 
 
 
478 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  27.38 
 
 
482 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  26.79 
 
 
478 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  27.25 
 
 
478 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  25.5 
 
 
482 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  25.5 
 
 
482 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25.5 
 
 
487 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.7 
 
 
490 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.5 
 
 
485 aa  160  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.7 
 
 
490 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  26.09 
 
 
644 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  25.7 
 
 
487 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  25.5 
 
 
482 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.3 
 
 
487 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  25 
 
 
490 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  28.44 
 
 
564 aa  151  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  31.71 
 
 
418 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  26.73 
 
 
523 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  29.79 
 
 
624 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  25.3 
 
 
503 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  22.8 
 
 
573 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  30.77 
 
 
572 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  23.7 
 
 
685 aa  81.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  21.34 
 
 
698 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  22.49 
 
 
495 aa  71.2  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  22.51 
 
 
560 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  23.81 
 
 
560 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  22.51 
 
 
560 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  23.48 
 
 
496 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  22.39 
 
 
496 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  22.75 
 
 
544 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  22.29 
 
 
1199 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  22.67 
 
 
496 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  35.92 
 
 
575 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  22.52 
 
 
559 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  21.26 
 
 
444 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  49.12 
 
 
463 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  22.74 
 
 
592 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  46.43 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  47.37 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  46.43 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  30.77 
 
 
623 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.07 
 
 
454 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  21.8 
 
 
578 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  33.9 
 
 
560 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  33.9 
 
 
560 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  24.04 
 
 
532 aa  53.9  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  49.06 
 
 
431 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  22.59 
 
 
619 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  27.69 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  27.34 
 
 
419 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  22.65 
 
 
435 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  22.76 
 
 
580 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  22.26 
 
 
565 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.29 
 
 
647 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.29 
 
 
647 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  45.45 
 
 
537 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  37 
 
 
490 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  21.61 
 
 
576 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  39.73 
 
 
492 aa  50.4  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  26.89 
 
 
427 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  19.94 
 
 
525 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  32.26 
 
 
628 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  21.85 
 
 
619 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>