170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1778 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  100 
 
 
572 aa  1193    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  51.36 
 
 
564 aa  579  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  31 
 
 
492 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  32.25 
 
 
491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  28.84 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  27.62 
 
 
523 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  30.94 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  30.04 
 
 
478 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  30.04 
 
 
478 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  27.99 
 
 
478 aa  177  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  29.94 
 
 
478 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  27.93 
 
 
482 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  29.94 
 
 
478 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  29.74 
 
 
478 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  29.74 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  29.54 
 
 
478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  29.34 
 
 
478 aa  164  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  26.99 
 
 
482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  27.38 
 
 
487 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  26.21 
 
 
490 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  26.82 
 
 
573 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.8 
 
 
482 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.8 
 
 
482 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  27.18 
 
 
487 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.8 
 
 
487 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  26.95 
 
 
485 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  26.74 
 
 
490 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  26.76 
 
 
490 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 
526 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  26.4 
 
 
519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  27.19 
 
 
535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  25.15 
 
 
516 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  24.8 
 
 
516 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  25.24 
 
 
527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  24.35 
 
 
576 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  24.13 
 
 
544 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  23.84 
 
 
560 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  24.64 
 
 
524 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  22.98 
 
 
560 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  22.6 
 
 
507 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  22.73 
 
 
560 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  22.87 
 
 
560 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  23.94 
 
 
559 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  24.49 
 
 
578 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  22.54 
 
 
560 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  24.83 
 
 
575 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  23.62 
 
 
580 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  30.66 
 
 
418 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  29.85 
 
 
685 aa  91.3  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  23.68 
 
 
529 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  23.57 
 
 
570 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  25.14 
 
 
532 aa  88.6  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  23.5 
 
 
562 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  30.77 
 
 
533 aa  87  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  28.37 
 
 
503 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  29.86 
 
 
537 aa  83.6  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  28.92 
 
 
530 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  23.18 
 
 
531 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  23.5 
 
 
527 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  29.86 
 
 
533 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  26.57 
 
 
541 aa  78.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.79 
 
 
496 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  41.51 
 
 
565 aa  76.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  23.66 
 
 
527 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  21.64 
 
 
566 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  25.52 
 
 
557 aa  74.3  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  30.77 
 
 
624 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  21.57 
 
 
723 aa  72.8  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  27.96 
 
 
698 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  39.08 
 
 
572 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  43.59 
 
 
563 aa  64.7  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  40.26 
 
 
557 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  21.17 
 
 
496 aa  64.3  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.23 
 
 
496 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  30.97 
 
 
528 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  24.21 
 
 
520 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  25.48 
 
 
536 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  21.97 
 
 
495 aa  60.8  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  25.29 
 
 
525 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  33.33 
 
 
531 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.74 
 
 
592 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  35.29 
 
 
623 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  35.92 
 
 
638 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  24.9 
 
 
528 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  49.02 
 
 
769 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  23.72 
 
 
616 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  22.76 
 
 
625 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  25.13 
 
 
556 aa  53.9  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.19 
 
 
619 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.11 
 
 
565 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  24.21 
 
 
646 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  23.58 
 
 
624 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  45 
 
 
481 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.72 
 
 
619 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  45 
 
 
481 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  42.86 
 
 
628 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  43.33 
 
 
481 aa  51.2  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  23.11 
 
 
491 aa  51.2  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  22.89 
 
 
535 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  48.21 
 
 
469 aa  50.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>