159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3007 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  100 
 
 		 527 aa  1062    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  91.46 
 
 		 527 aa  977    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  60.76 
 
 		 507 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  42.4 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  36.5 
 
 		 529 aa  296  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  38.48 
 
 		 520 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  33.52 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  33.52 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  35.2 
 
 		 524 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  36.16 
 
 		 528 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  33.64 
 
 		 527 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  35.83 
 
 		 530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  33.2 
 
 		 537 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  34.29 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  33.46 
 
 		 519 aa  266  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  32.83 
 
 		 533 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  32.65 
 
 		 532 aa  256  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  32.77 
 
 		 533 aa  256  9e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  32.72 
 
 		 535 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  34.03 
 
 		 541 aa  252  9.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  34.45 
 
 		 535 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  37.04 
 
 		 531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  36.35 
 
 		 536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  30.91 
 
 		 557 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  28.66 
 
 		 646 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  28.71 
 
 		 638 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  27.14 
 
 		 644 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  31.18 
 
 		 492 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  29.6 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  28.7 
 
 		 478 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.38 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.19 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.1 
 
 		 478 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.81 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.21 
 
 		 478 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.21 
 
 		 478 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.77 
 
 		 482 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.48 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  27.31 
 
 		 491 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  25.1 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.56 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.8 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.6 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.8 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.8 
 
 		 487 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.6 
 
 		 490 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.8 
 
 		 485 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.29 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.23 
 
 		 487 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.05 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  31.3 
 
 		 418 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  22.42 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  24.18 
 
 		 564 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  23.76 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  27.05 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  24.49 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  25.96 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  23.66 
 
 		 572 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  24.31 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  23.55 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  23.82 
 
 		 528 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  66.67 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1545  amine oxidase  23.57 
 
 		 732 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  64.1 
 
 		 462 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  24.18 
 
 		 698 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  64.1 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  24.11 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  35.29 
 
 		 647 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  71.79 
 
 		 463 aa  51.2  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  35.29 
 
 		 647 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  55.81 
 
 		 454 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  27.78 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  58.54 
 
 		 562 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  33.33 
 
 		 557 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  54.9 
 
 		 474 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  37.78 
 
 		 563 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  64.1 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  57.5 
 
 		 457 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  61.9 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  61.9 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  26.36 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  47.76 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  36.36 
 
 		 645 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  58.33 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.38 
 
 		 784 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.78 
 
 		 495 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  27.13 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  36.17 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  46 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  59.18 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  34.31 
 
 		 157 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  50.82 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  57.14 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  37.93 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 769 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  58.54 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  38.64 
 
 		 510 aa  47.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  39.44 
 
 		 647 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  36.71 
 
 		 644 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>