155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1536 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  100 
 
 		 557 aa  1154    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  70.29 
 
 		 562 aa  813    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  67.7 
 
 		 563 aa  781    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  47.45 
 
 		 723 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  43.3 
 
 		 575 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  31.6 
 
 		 572 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  30.94 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  29.95 
 
 		 576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  30.02 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  30.6 
 
 		 560 aa  210  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  31.2 
 
 		 560 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  30.55 
 
 		 560 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  30.42 
 
 		 559 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  29.31 
 
 		 570 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  30.65 
 
 		 580 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  30.42 
 
 		 544 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  30.18 
 
 		 560 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  30.18 
 
 		 560 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  30.53 
 
 		 566 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  29.6 
 
 		 623 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  29.71 
 
 		 649 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  30.18 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.54 
 
 		 492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.38 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  27.94 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  25.9 
 
 		 644 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  23.12 
 
 		 803 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  25.39 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.28 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.44 
 
 		 485 aa  97.8  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  25.34 
 
 		 482 aa  97.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  25.34 
 
 		 482 aa  97.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.76 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.75 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25.2 
 
 		 487 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 487 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.85 
 
 		 490 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  22.89 
 
 		 573 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  24.41 
 
 		 482 aa  87.8  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  31.79 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  27.6 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  24.22 
 
 		 707 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  40.86 
 
 		 157 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.17 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  33.81 
 
 		 564 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.09 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.09 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  25.51 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.91 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.83 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.83 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  40.45 
 
 		 523 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  43.01 
 
 		 698 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.83 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.83 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  38.27 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  37.5 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  37.5 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  36.59 
 
 		 498 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  43.94 
 
 		 685 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  40.23 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  34.57 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  34.57 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  34.57 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  40.79 
 
 		 419 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  33.73 
 
 		 532 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1930  hypothetical protein  39.66 
 
 		 87 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  58.14 
 
 		 387 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  58.14 
 
 		 387 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  33.73 
 
 		 490 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  33.33 
 
 		 527 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 493 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  45.33 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  46.43 
 
 		 537 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  30.3 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  35.96 
 
 		 537 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  30.4 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  40.26 
 
 		 572 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  34.83 
 
 		 533 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  43.75 
 
 		 462 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  33.66 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  35 
 
 		 465 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  48.98 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  37.04 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  56.82 
 
 		 463 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  37.04 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  25.77 
 
 		 624 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  27.34 
 
 		 353 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  55.26 
 
 		 436 aa  48.1  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  62.5 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  38.46 
 
 		 609 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  44 
 
 		 488 aa  47.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  46.67 
 
 		 421 aa  47.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 494 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  27.08 
 
 		 458 aa  47.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  34.57 
 
 		 494 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  43.1 
 
 		 378 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  34.57 
 
 		 578 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  47.62 
 
 		 445 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  40 
 
 		 486 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>