20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3151 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  100 
 
 		 707 aa  1436    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  23.26 
 
 		 575 aa  92  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  24.38 
 
 		 557 aa  92  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  24.11 
 
 		 562 aa  87.4  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  22.5 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  23.89 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  22.94 
 
 		 723 aa  77.4  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  22.85 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  22.03 
 
 		 623 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  22.11 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  21.22 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  22.82 
 
 		 566 aa  63.9  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  22.94 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  23.35 
 
 		 560 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  23.35 
 
 		 560 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  22.36 
 
 		 556 aa  47.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  26.35 
 
 		 564 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  23.57 
 
 		 572 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  20.7 
 
 		 803 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  28.68 
 
 		 560 aa  44.3  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>