109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3740 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  67.7 
 
 
557 aa  781    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  76.38 
 
 
562 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  100 
 
 
563 aa  1167    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  49.55 
 
 
723 aa  544  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  44.67 
 
 
575 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  30.88 
 
 
576 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  32.17 
 
 
572 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  31.44 
 
 
578 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  32.16 
 
 
565 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  30.78 
 
 
570 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  30.05 
 
 
560 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  30.51 
 
 
560 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  30.42 
 
 
560 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  30.51 
 
 
544 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  30.33 
 
 
560 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  31.81 
 
 
566 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  30.58 
 
 
559 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  30.81 
 
 
580 aa  207  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  30.05 
 
 
560 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  30.3 
 
 
556 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  29.35 
 
 
623 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  28.37 
 
 
649 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.62 
 
 
492 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  24.32 
 
 
803 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  25.49 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  25.12 
 
 
644 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25.38 
 
 
478 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.58 
 
 
491 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  26.04 
 
 
485 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  26.23 
 
 
487 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  26.68 
 
 
482 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.04 
 
 
482 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.04 
 
 
482 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.04 
 
 
487 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  26.04 
 
 
490 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  26.04 
 
 
490 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  25.64 
 
 
487 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  26.09 
 
 
490 aa  98.6  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  23.52 
 
 
573 aa  97.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.44 
 
 
478 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.44 
 
 
478 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  24.47 
 
 
478 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.27 
 
 
478 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.27 
 
 
478 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.27 
 
 
478 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  25.24 
 
 
478 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.64 
 
 
482 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.08 
 
 
478 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  24.02 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  31.28 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  22.03 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  36.84 
 
 
564 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  21.68 
 
 
707 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  41.49 
 
 
157 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25.17 
 
 
459 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  35.71 
 
 
532 aa  50.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  37.78 
 
 
527 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  36.59 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  43.59 
 
 
572 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  36.9 
 
 
490 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  41.77 
 
 
503 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  45.33 
 
 
698 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 
493 aa  48.5  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1930  hypothetical protein  48 
 
 
87 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  24.23 
 
 
624 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  42.47 
 
 
419 aa  48.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  37.18 
 
 
498 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  37.18 
 
 
498 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  35.37 
 
 
498 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  59.09 
 
 
387 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  59.09 
 
 
387 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  35.37 
 
 
494 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  51.11 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  53.33 
 
 
463 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  35.29 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 
494 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  35.37 
 
 
494 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  40.3 
 
 
685 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  51.11 
 
 
537 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  32.93 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 
578 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  32.93 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  32.93 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  33.04 
 
 
510 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  34.44 
 
 
527 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  32.89 
 
 
381 aa  44.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  58.54 
 
 
657 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  35.87 
 
 
421 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  35.56 
 
 
507 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  43.75 
 
 
502 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  43.75 
 
 
502 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  43.75 
 
 
502 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  24.03 
 
 
458 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
769 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.85 
 
 
501 aa  44.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04110  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01002)  38.37 
 
 
492 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  24.23 
 
 
434 aa  44.3  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.94 
 
 
502 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  56.41 
 
 
436 aa  44.3  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  42.67 
 
 
478 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>