83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3191 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  100 
 
 
623 aa  1285    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  49.77 
 
 
649 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  38.74 
 
 
570 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  38.78 
 
 
578 aa  359  7e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  40.07 
 
 
576 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  35.32 
 
 
560 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  35.32 
 
 
560 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  37.56 
 
 
572 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  35.32 
 
 
560 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  38.42 
 
 
565 aa  340  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  35.7 
 
 
559 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  35.16 
 
 
560 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  38.09 
 
 
580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  34.03 
 
 
560 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  36.05 
 
 
544 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  38.66 
 
 
566 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  37.6 
 
 
556 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  29.6 
 
 
557 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  28.15 
 
 
575 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  29.2 
 
 
562 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  29.35 
 
 
563 aa  173  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  27.86 
 
 
723 aa  154  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  23.88 
 
 
644 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  23.66 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  23.59 
 
 
478 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  26.59 
 
 
803 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  23.04 
 
 
564 aa  72  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  32.95 
 
 
523 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  21.73 
 
 
573 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.87 
 
 
482 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  40.74 
 
 
478 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.06 
 
 
490 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.69 
 
 
482 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.69 
 
 
482 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.69 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.84 
 
 
485 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  23.24 
 
 
519 aa  62.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.24 
 
 
490 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.97 
 
 
487 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.46 
 
 
487 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  40.51 
 
 
503 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.64 
 
 
490 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  30.77 
 
 
533 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  38.54 
 
 
157 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  30.77 
 
 
537 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  38.37 
 
 
419 aa  53.9  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  47.27 
 
 
516 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  33.09 
 
 
535 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  47.27 
 
 
516 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  34.31 
 
 
507 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  23.95 
 
 
707 aa  50.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  29.91 
 
 
532 aa  50.4  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  44.9 
 
 
527 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  34.74 
 
 
541 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  42.42 
 
 
645 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  35.23 
 
 
491 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  31.96 
 
 
528 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  24.17 
 
 
447 aa  47.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  34.95 
 
 
531 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  32.98 
 
 
527 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  50 
 
 
592 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  24.24 
 
 
531 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  33.68 
 
 
527 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  41.67 
 
 
456 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 
499 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  39.22 
 
 
474 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  39.76 
 
 
502 aa  45.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  56.76 
 
 
558 aa  45.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  45 
 
 
457 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  47.5 
 
 
448 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  42.86 
 
 
495 aa  45.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  48.89 
 
 
644 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  36.84 
 
 
492 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  46.67 
 
 
520 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  33.73 
 
 
478 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 
526 aa  44.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  33.73 
 
 
478 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  27.35 
 
 
533 aa  44.3  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0440  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.37 
 
 
402 aa  44.3  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  40.82 
 
 
524 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 
529 aa  43.9  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  52.38 
 
 
428 aa  43.9  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  32.67 
 
 
445 aa  43.9  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>