88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1110 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  60.55 
 
 		 560 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  61.77 
 
 		 570 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  59.09 
 
 		 565 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  62.45 
 
 		 566 aa  699    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  60.8 
 
 		 572 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  88.73 
 
 		 578 aa  1049    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  61.65 
 
 		 560 aa  734    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  66.32 
 
 		 580 aa  788    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  61.83 
 
 		 560 aa  739    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  100 
 
 		 576 aa  1174    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  60.18 
 
 		 560 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  61.28 
 
 		 559 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  61.65 
 
 		 560 aa  736    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  60.89 
 
 		 544 aa  728    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  58.27 
 
 		 556 aa  624  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  40.07 
 
 		 623 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  34.7 
 
 		 649 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  30.88 
 
 		 563 aa  232  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  29.88 
 
 		 557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  30.02 
 
 		 562 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  30.23 
 
 		 723 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  30.35 
 
 		 575 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.35 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  24.02 
 
 		 564 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  24.79 
 
 		 803 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  25.95 
 
 		 487 aa  105  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  26.04 
 
 		 487 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.1 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.1 
 
 		 482 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.1 
 
 		 482 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  26.1 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  25.35 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  25.3 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  22.86 
 
 		 523 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  24.29 
 
 		 482 aa  100  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  22.98 
 
 		 644 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.45 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  25.25 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.45 
 
 		 490 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25.87 
 
 		 478 aa  97.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  23.72 
 
 		 572 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.85 
 
 		 478 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.85 
 
 		 478 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  23.79 
 
 		 478 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  23.25 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 		 478 aa  87  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  23.2 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  22.75 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  22.71 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  22.51 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  23.84 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  22.05 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  30.86 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  49.37 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  22.4 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  21.71 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  22.67 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  23.04 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  25 
 
 		 624 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  22.16 
 
 		 535 aa  54.7  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  23.05 
 
 		 531 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  38.55 
 
 		 355 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  38.55 
 
 		 332 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  29.39 
 
 		 470 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  21.95 
 
 		 533 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  22.56 
 
 		 496 aa  50.4  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  33 
 
 		 580 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  41.54 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  35.37 
 
 		 557 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  23.65 
 
 		 465 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  33.66 
 
 		 494 aa  47.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  26.23 
 
 		 519 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  31.48 
 
 		 528 aa  47.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  26.23 
 
 		 526 aa  47.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  31.72 
 
 		 428 aa  47  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  35 
 
 		 367 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  36.36 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  32.99 
 
 		 527 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  45.61 
 
 		 480 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  32.32 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  38.75 
 
 		 456 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  34.78 
 
 		 343 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  36.76 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  41.11 
 
 		 480 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  51.06 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  20.53 
 
 		 533 aa  44.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  40.32 
 
 		 698 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 		 350 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>