83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4304 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  100 
 
 		 649 aa  1345    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  49.77 
 
 		 623 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  37.4 
 
 		 570 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  34.74 
 
 		 572 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  35.5 
 
 		 576 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  35.11 
 
 		 578 aa  317  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  36.42 
 
 		 566 aa  316  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  34.19 
 
 		 560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  33.81 
 
 		 560 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  33.07 
 
 		 559 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  33.65 
 
 		 560 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  33.33 
 
 		 544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  33.69 
 
 		 565 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  34.23 
 
 		 580 aa  307  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  32.96 
 
 		 560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  32.96 
 
 		 560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  34.92 
 
 		 556 aa  279  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  29.71 
 
 		 557 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  28.3 
 
 		 562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  28.32 
 
 		 563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  28.51 
 
 		 575 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  26.09 
 
 		 723 aa  150  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  24.02 
 
 		 644 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  26.97 
 
 		 803 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  22.95 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  23.33 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  28.14 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  38.53 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  45.45 
 
 		 492 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  44.16 
 
 		 503 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  46.75 
 
 		 478 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  28.5 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  36.45 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  28.08 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  28.08 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  28.08 
 
 		 487 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  28.3 
 
 		 485 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  28.3 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  27.4 
 
 		 482 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  24.34 
 
 		 707 aa  55.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  26.83 
 
 		 490 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  27.32 
 
 		 487 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  28.16 
 
 		 487 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  27.83 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  25.62 
 
 		 418 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  55.56 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  27.4 
 
 		 478 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  27.4 
 
 		 478 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  27.62 
 
 		 478 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  27.14 
 
 		 478 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  27.14 
 
 		 478 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  51.11 
 
 		 516 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  31.31 
 
 		 507 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  33.7 
 
 		 527 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  29.58 
 
 		 491 aa  50.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  27.36 
 
 		 478 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  39.39 
 
 		 457 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  27.4 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  27.23 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  32.97 
 
 		 541 aa  48.5  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  47.06 
 
 		 528 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  40.85 
 
 		 456 aa  48.5  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  27.14 
 
 		 478 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 		 526 aa  47.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  33.04 
 
 		 644 aa  47.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  39.47 
 
 		 456 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  47.5 
 
 		 448 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  41.1 
 
 		 157 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  30.77 
 
 		 353 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 519 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  22.75 
 
 		 624 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.2 
 
 		 667 aa  45.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  56.41 
 
 		 495 aa  45.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  32.67 
 
 		 532 aa  44.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  52.5 
 
 		 527 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  34.96 
 
 		 698 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  21.77 
 
 		 572 aa  44.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  46.34 
 
 		 647 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  51.16 
 
 		 469 aa  44.3  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  43.18 
 
 		 445 aa  44.3  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  52.5 
 
 		 527 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  32 
 
 		 350 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  50 
 
 		 541 aa  43.9  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>