115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8288 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  100 
 
 		 723 aa  1501    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  49.55 
 
 		 563 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  47.45 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  46.73 
 
 		 562 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  38.81 
 
 		 575 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  30.23 
 
 		 576 aa  208  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  29.83 
 
 		 565 aa  207  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  30.34 
 
 		 578 aa  206  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  29.69 
 
 		 572 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  30.09 
 
 		 566 aa  193  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  28.7 
 
 		 570 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  28.18 
 
 		 560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  28.18 
 
 		 560 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  28.44 
 
 		 544 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  28.36 
 
 		 560 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  28.81 
 
 		 559 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  28.52 
 
 		 560 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  28.7 
 
 		 580 aa  186  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  27.57 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  27.86 
 
 		 623 aa  154  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  26.56 
 
 		 556 aa  145  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  26.12 
 
 		 649 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.09 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.57 
 
 		 491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  22.8 
 
 		 803 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.3 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.25 
 
 		 485 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  25.3 
 
 		 482 aa  101  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  25.29 
 
 		 490 aa  101  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  25.3 
 
 		 482 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  25.3 
 
 		 482 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25.3 
 
 		 487 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.59 
 
 		 487 aa  100  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.39 
 
 		 490 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  26.32 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  24.12 
 
 		 478 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  22.84 
 
 		 644 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  25.14 
 
 		 503 aa  92  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  22.45 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  23.39 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  24.1 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.17 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  25.4 
 
 		 573 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.34 
 
 		 478 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.34 
 
 		 478 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  35.29 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.6 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.6 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.4 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  23.63 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  28.95 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  23.6 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  21.38 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  45.95 
 
 		 698 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  24.9 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  37.63 
 
 		 157 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  40.23 
 
 		 428 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  21.55 
 
 		 524 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  23.08 
 
 		 531 aa  54.3  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  22.73 
 
 		 707 aa  52.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  51.06 
 
 		 413 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  54.55 
 
 		 657 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  38 
 
 		 381 aa  51.2  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  35.87 
 
 		 387 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  34.74 
 
 		 387 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  22.28 
 
 		 624 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  30.81 
 
 		 452 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  41.82 
 
 		 496 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  53.33 
 
 		 465 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  32.67 
 
 		 450 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  39.24 
 
 		 454 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  32.67 
 
 		 450 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  21.68 
 
 		 496 aa  49.3  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0298  amine oxidase  52.17 
 
 		 429 aa  47.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0530  glutamate synthase, small subunit  49.15 
 
 		 461 aa  47.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0212146  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  33.33 
 
 		 492 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  47.92 
 
 		 369 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10455  hypothetical protein  42 
 
 		 439 aa  47.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  29.2 
 
 		 493 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  31.58 
 
 		 387 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  31.58 
 
 		 387 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  37.04 
 
 		 353 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 		 527 aa  46.2  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  21.66 
 
 		 449 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  33.33 
 
 		 382 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  38.75 
 
 		 508 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  39.47 
 
 		 508 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  35.29 
 
 		 685 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  31.63 
 
 		 439 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.84 
 
 		 725 aa  45.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1956  amine oxidase  37.66 
 
 		 425 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  50 
 
 		 445 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  32.26 
 
 		 378 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  56.1 
 
 		 415 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  22.29 
 
 		 454 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  56.82 
 
 		 531 aa  45.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 484 aa  45.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  36.08 
 
 		 434 aa  45.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  53.66 
 
 		 415 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>