189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2098 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  76.39 
 
 		 415 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  100 
 
 		 415 aa  862    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  80.96 
 
 		 415 aa  705    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  76.63 
 
 		 415 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  72.53 
 
 		 415 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  71.57 
 
 		 415 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  69.64 
 
 		 415 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  67.95 
 
 		 415 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  56.66 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  57 
 
 		 416 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  57 
 
 		 416 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  57 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  56.76 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  57.38 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  54.83 
 
 		 416 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  54.83 
 
 		 416 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  55.07 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  55.07 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  54.63 
 
 		 426 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  54.59 
 
 		 416 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  54.05 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  51.44 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  50.84 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  50.24 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  50.48 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  52.37 
 
 		 422 aa  441  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0814  hypothetical protein  55.95 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  51.69 
 
 		 417 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  50.84 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  48.32 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  51.57 
 
 		 417 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1489  amine oxidase  53.9 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  50.36 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  52.37 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0129  hypothetical protein  53.12 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2098  amine oxidase  52.38 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2327  hypothetical protein  52.48 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1177  FAD dependent oxidoreductase  51.46 
 
 		 420 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01779  dehydrogenase  49.75 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0510493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1956  amine oxidase  50.12 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1867  amine oxidase  48.54 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  47.75 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1616  amine oxidase  48.43 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  49.04 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0088  amine oxidase flavin-containing  46.12 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  44.35 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  46.49 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6096  FAD dependent oxidoreductase  46.38 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0754929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0236  putative dehydrogenase  47.29 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  46.25 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  46.79 
 
 		 421 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1622  amine oxidase  45.54 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 		 439 aa  356  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0462  amine oxidase  48.95 
 
 		 439 aa  356  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2398  FAD dependent oxidoreductase  46.17 
 
 		 434 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1053  FAD dependent oxidoreductase  46.04 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2253  amine oxidase  45.28 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1443  amine oxidase  44.95 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  45.41 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2971  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  45.11 
 
 		 458 aa  346  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  45.65 
 
 		 449 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1390  amine oxidase  45.3 
 
 		 445 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2437  amine oxidase  43.69 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3930  hypothetical protein  43.13 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1176  amine oxidase  38.46 
 
 		 577 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2556  FAD dependent oxidoreductase  43.29 
 
 		 437 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108905  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2567  amine oxidase  44.08 
 
 		 437 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2840  amine oxidase  44.79 
 
 		 437 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1555  amine oxidase  45.04 
 
 		 445 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.5068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  44.1 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2904  amine oxidase  43.84 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1869  amine oxidase  41.83 
 
 		 462 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0723  amine oxidase  43.51 
 
 		 461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.885481  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1890  amine oxidase  41.79 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0350  amine oxidase  41.93 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5886  amine oxidase  44.47 
 
 		 448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2025  amine oxidase  43.83 
 
 		 447 aa  319  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  43.22 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0911  amine oxidase  42.28 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1971  amine oxidase  38.48 
 
 		 462 aa  306  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  41.55 
 
 		 667 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  39.66 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  40.98 
 
 		 434 aa  292  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  40.48 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  41.02 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0414  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308842  normal  0.291599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  41.65 
 
 		 454 aa  289  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1802  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 457 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000561447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  39.81 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  39.81 
 
 		 430 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  39.02 
 
 		 877 aa  276  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  37.94 
 
 		 465 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10455  hypothetical protein  38.57 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0298  amine oxidase  38.63 
 
 		 429 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3583  amine oxidase  38.35 
 
 		 421 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  36.51 
 
 		 949 aa  240  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>