50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5898 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  100 
 
 		 803 aa  1659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  24.32 
 
 		 563 aa  122  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  22.64 
 
 		 562 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  23.92 
 
 		 575 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  22.8 
 
 		 723 aa  105  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  26.26 
 
 		 578 aa  104  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  24.54 
 
 		 576 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  23.12 
 
 		 557 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  25.77 
 
 		 560 aa  101  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  24.96 
 
 		 560 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  24.38 
 
 		 559 aa  94.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  24.64 
 
 		 544 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  23.89 
 
 		 560 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  24.59 
 
 		 560 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  24.59 
 
 		 560 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  23.89 
 
 		 570 aa  87.4  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  23.29 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  23.85 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  23.89 
 
 		 580 aa  84  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  26.59 
 
 		 623 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  22.63 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  25.34 
 
 		 556 aa  70.5  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  21.74 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  26.97 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  32.29 
 
 		 523 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 491 aa  48.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  45.07 
 
 		 503 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  49.02 
 
 		 2135 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  59.46 
 
 		 2126 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  57.89 
 
 		 491 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  25.82 
 
 		 478 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25.11 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  54 
 
 		 454 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.89 
 
 		 471 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 		 492 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  53.66 
 
 		 527 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  52.63 
 
 		 491 aa  45.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.89 
 
 		 492 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  52.63 
 
 		 491 aa  44.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  38.57 
 
 		 456 aa  45.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 427 aa  45.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.81 
 
 		 466 aa  45.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  43.64 
 
 		 580 aa  44.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  45.65 
 
 		 491 aa  44.3  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1200  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.18 
 
 		 473 aa  44.7  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.92 
 
 		 478 aa  44.3  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  40.91 
 
 		 843 aa  44.3  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.92 
 
 		 478 aa  44.3  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  38.03 
 
 		 525 aa  44.3  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  51.28 
 
 		 462 aa  43.9  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>