More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2578 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
427 aa  826    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.75 
 
 
399 aa  315  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  44.56 
 
 
382 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  44.56 
 
 
382 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  44.56 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.49 
 
 
381 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.49 
 
 
381 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.49 
 
 
381 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 
380 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  40.72 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  35.29 
 
 
378 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  38.1 
 
 
371 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.75 
 
 
377 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3504  flavin-containing monooxygenase FMO  32.63 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3273  flavin-containing monooxygenase FMO  34.93 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.304511  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  28.08 
 
 
347 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.15 
 
 
362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.15 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.76 
 
 
348 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  27.03 
 
 
347 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  27.03 
 
 
347 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  27.03 
 
 
347 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  27.03 
 
 
347 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  27.03 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4944  flavin-containing monooxygenase FMO  29.7 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310384  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0583  flavin-containing monooxygenase FMO  29.4 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.43 
 
 
362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.55 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  27.56 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  26.79 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  30.02 
 
 
448 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.05 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  26.77 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  26.19 
 
 
446 aa  117  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  29.61 
 
 
364 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.68 
 
 
349 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0603  flavin-containing monooxygenase  27.78 
 
 
447 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  27.18 
 
 
347 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  28.74 
 
 
432 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1820  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  29.34 
 
 
454 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  26.84 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0443  flavin-containing monooxygenase  27.2 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337001  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.62 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  26.87 
 
 
480 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  30.06 
 
 
442 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.63 
 
 
372 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.29 
 
 
348 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1951  flavin-containing monooxygenase  29.55 
 
 
458 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183741  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  24.71 
 
 
558 aa  106  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3872  flavin-containing monooxygenase FMO  28.74 
 
 
461 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  26.87 
 
 
638 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  27.18 
 
 
460 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4856  Flavin-containing monooxygenase  24.53 
 
 
447 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.92 
 
 
352 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  29.01 
 
 
360 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0696  flavin-containing monooxygenase FMO  28.53 
 
 
452 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.21 
 
 
348 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.99 
 
 
358 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  25.49 
 
 
609 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  28.45 
 
 
573 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
642 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
642 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
419 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  25.26 
 
 
610 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  39.2 
 
 
439 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  39.2 
 
 
439 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25340  predicted flavoprotein involved in K+ transport  33.04 
 
 
478 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.123027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4373  flavin-containing monooxygenase  28.49 
 
 
446 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  30.39 
 
 
352 aa  97.8  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1820  flavin-containing monooxygenase FMO  27.25 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.24 
 
 
601 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.67 
 
 
367 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.87 
 
 
361 aa  94.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  38.54 
 
 
450 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  38.54 
 
 
450 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
459 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  27.11 
 
 
505 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2346  monooxygenase flavin-binding family protein  26.6 
 
 
482 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  36.87 
 
 
439 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  24.42 
 
 
598 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  39 
 
 
440 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  33.5 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  39 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2861  flavin-containing monooxygenase FMO  29.55 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000341045  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  35.47 
 
 
417 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  38.5 
 
 
470 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1422  Flavin-containing monooxygenase  27.38 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1971  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  26.96 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.69 
 
 
448 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.25 
 
 
361 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  29.85 
 
 
640 aa  90.1  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  30.45 
 
 
524 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1752  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  26.59 
 
 
450 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.525754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1799  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  26.59 
 
 
450 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
512 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1416  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  26.78 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3259  monooxygenase, flavin-binding  26.7 
 
 
494 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.206652  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.96 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>