70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1732 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  57.38 
 
 		 560 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  70.16 
 
 		 570 aa  786    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  66.85 
 
 		 565 aa  742    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  100 
 
 		 566 aa  1154    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  68.01 
 
 		 572 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  60.99 
 
 		 578 aa  692    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  57.74 
 
 		 560 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  57.56 
 
 		 560 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  62.41 
 
 		 580 aa  692    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  57.38 
 
 		 560 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  62.39 
 
 		 576 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  57.92 
 
 		 560 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  57.77 
 
 		 559 aa  675    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  57.8 
 
 		 544 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  56.37 
 
 		 556 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  38.66 
 
 		 623 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  36.58 
 
 		 649 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  31.2 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  31.81 
 
 		 563 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  30.53 
 
 		 557 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  30.09 
 
 		 723 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  27.29 
 
 		 575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.56 
 
 		 492 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  21.97 
 
 		 564 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.13 
 
 		 478 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.8 
 
 		 487 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.52 
 
 		 490 aa  94.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.8 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.8 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.6 
 
 		 482 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.8 
 
 		 487 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.6 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.4 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.2 
 
 		 490 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.2 
 
 		 487 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  23.29 
 
 		 803 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  24.38 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.9 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  21.51 
 
 		 523 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  22.92 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.04 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.04 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  25 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  29.26 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  27.66 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  27.66 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  28.72 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  28.72 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  28.72 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  30.17 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  22.14 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  23.01 
 
 		 644 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  27.98 
 
 		 418 aa  54.3  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  25.26 
 
 		 624 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  23.09 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  29.67 
 
 		 157 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  36.89 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1984  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  53.19 
 
 		 576 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  38.96 
 
 		 350 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  39.73 
 
 		 557 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  29.03 
 
 		 573 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  20.93 
 
 		 527 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  32.56 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  21.83 
 
 		 1274 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  32.56 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  35.53 
 
 		 456 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  31.36 
 
 		 527 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  40 
 
 		 638 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  38.67 
 
 		 408 aa  43.9  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>