192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1984 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1984  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 
576 aa  1167    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1060  hypothetical protein  30.43 
 
 
463 aa  172  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2158  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.81 
 
 
463 aa  171  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0024  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.1 
 
 
467 aa  153  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0020  hypothetical protein  29.23 
 
 
470 aa  139  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.177122  normal  0.337265 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1167  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  23.85 
 
 
476 aa  67.4  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  24.3 
 
 
1028 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  23.4 
 
 
961 aa  62.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4341  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  23.7 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159082  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  22.93 
 
 
1005 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 
983 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.54 
 
 
1000 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000039  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.62 
 
 
487 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4832  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.38 
 
 
504 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.619833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2331  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  21.89 
 
 
463 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790934  normal  0.848364 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0221  hypothetical protein  23.03 
 
 
459 aa  57  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000130576  normal  0.0122393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  24.06 
 
 
955 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.46 
 
 
976 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4414  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  22.35 
 
 
458 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160512  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4425  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  27.59 
 
 
494 aa  57  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0609714  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0747  pyridine nucleotide- disulphide oxidoreductase family protein  21.77 
 
 
477 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606696  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1931  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.5 
 
 
477 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
984 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1000  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  37.23 
 
 
778 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.83 
 
 
1009 aa  55.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2520  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.56 
 
 
463 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.174199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  24.5 
 
 
1003 aa  54.3  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2742  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  25.11 
 
 
493 aa  53.9  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  0.340256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0885  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  27.32 
 
 
464 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4398  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  27.12 
 
 
473 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  41.98 
 
 
647 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1891  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  29.52 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00727838  normal  0.169862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  24.08 
 
 
1002 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2708  putative opine oxidase subunit a  29.52 
 
 
472 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3537  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  26.67 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0414628  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6005  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.13 
 
 
468 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  23.05 
 
 
1000 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  26.17 
 
 
464 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4732  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  26.25 
 
 
480 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3631  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  26.25 
 
 
480 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.572626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4435  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
464 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  32 
 
 
771 aa  51.2  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
492 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  22.91 
 
 
1009 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.11 
 
 
1010 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0143  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.11 
 
 
1010 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.33 
 
 
699 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6498  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.19 
 
 
464 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.782695  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3575  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  36.62 
 
 
736 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7055  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
476 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  23.55 
 
 
1007 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  23.55 
 
 
1007 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6110  2,4-dienoyl-CoA reductase  27.22 
 
 
676 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4374  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  30.48 
 
 
471 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1884  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.66 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.254068  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.79 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2712  D-nopaline dehydrogenase  21.79 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1078  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  39.44 
 
 
744 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.462282  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5702  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  28.04 
 
 
478 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6066  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  28.04 
 
 
478 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.86 
 
 
1013 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0754  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.09 
 
 
474 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4427  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  21.84 
 
 
477 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428597  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  26.3 
 
 
1008 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  21.55 
 
 
961 aa  48.9  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5372  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  27.72 
 
 
481 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.420802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1831  opine oxidase subunit A  23.33 
 
 
455 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  55.81 
 
 
503 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.11 
 
 
936 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000976966 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6550  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  27.1 
 
 
478 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.453687 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1584  heterodisulfide reductase, subunit A  45.45 
 
 
412 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00494789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2193  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.38 
 
 
645 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000298441  normal  0.0270911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  59.46 
 
 
523 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  31.58 
 
 
501 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.27 
 
 
784 aa  48.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0927  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  25 
 
 
474 aa  47.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  53.49 
 
 
472 aa  48.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8301  D-nopaline dehydrogenase  20.78 
 
 
464 aa  48.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.909485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2309  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  31.63 
 
 
96 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.48 
 
 
591 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0036  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  39.06 
 
 
750 aa  47.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00274533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  47.83 
 
 
810 aa  47.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.98 
 
 
420 aa  47.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.95 
 
 
1002 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.95 
 
 
1002 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.3 
 
 
987 aa  47.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  28.95 
 
 
889 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  28.95 
 
 
1002 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  22.41 
 
 
977 aa  47.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0206  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
488 aa  47  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  30.23 
 
 
516 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  29.38 
 
 
1003 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  25.86 
 
 
1009 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  30.23 
 
 
516 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1583  heterodisulfide reductase, subunit A/hydrogenase, delta subunit, putative  39.06 
 
 
750 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  31.53 
 
 
650 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0037  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.51 
 
 
413 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0158995  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 
513 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0639  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  27.75 
 
 
718 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.71 
 
 
1016 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>