49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0221 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0221  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  939    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000130576  normal  0.0122393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1167  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.34 
 
 		 476 aa  286  8e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  22.44 
 
 		 961 aa  72.4  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1984  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  23.03 
 
 		 576 aa  57  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.97 
 
 		 963 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  23.15 
 
 		 977 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2309  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.58 
 
 		 96 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25.69 
 
 		 1009 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.23 
 
 		 1000 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.76 
 
 		 967 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0087  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.46 
 
 		 93 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000296094  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.84 
 
 		 984 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.62 
 
 		 977 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  23.93 
 
 		 1000 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  25.08 
 
 		 961 aa  50.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.87 
 
 		 1009 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1752  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.5 
 
 		 91 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.15 
 
 		 988 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  26.38 
 
 		 1008 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0885  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  20.99 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.78 
 
 		 997 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  22.33 
 
 		 992 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6293  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.77 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1729  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 99 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2520  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  20.88 
 
 		 463 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.174199  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 500 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 496 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6533  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  24.29 
 
 		 471 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4444  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2331  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  20.74 
 
 		 463 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790934  normal  0.848364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  22.56 
 
 		 968 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0273  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 95 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0754  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  22.01 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.72 
 
 		 993 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6213  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0689  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  30.56 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6382  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  30.14 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6615  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  22.63 
 
 		 1000 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  22.98 
 
 		 999 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6085  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  20.07 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.829261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4832  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.87 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.619833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  22.55 
 
 		 955 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.28 
 
 		 1003 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3209  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  18.53 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  24.22 
 
 		 995 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  22.3 
 
 		 1002 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>