254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0273 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0273  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 
95 aa  190  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0969  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  56.76 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00333813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6533  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.04 
 
 
471 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1729  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.11 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0087  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  53.95 
 
 
93 aa  81.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000296094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 
983 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4414  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.96 
 
 
458 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160512  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 
984 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4341  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.24 
 
 
463 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159082  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8301  D-nopaline dehydrogenase  37.93 
 
 
464 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.909485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2712  D-nopaline dehydrogenase  39.76 
 
 
464 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 
492 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8316  D-nopaline dehydrogenase  38.55 
 
 
469 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1831  opine oxidase subunit A  36.14 
 
 
455 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  37.08 
 
 
464 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0206  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.29 
 
 
488 aa  70.1  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000039  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.84 
 
 
487 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.24 
 
 
1003 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4398  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.36 
 
 
473 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2331  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  40 
 
 
463 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790934  normal  0.848364 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1688  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  32.18 
 
 
462 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.61791  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4934  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.59 
 
 
460 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1752  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  35.96 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0689  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  41.77 
 
 
483 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100515  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4374  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  41.77 
 
 
471 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2520  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.92 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.174199  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7055  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.59 
 
 
476 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 
500 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 
500 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1837  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  34.15 
 
 
461 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 
496 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2708  putative opine oxidase subunit a  36.59 
 
 
472 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1891  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  36.59 
 
 
468 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00727838  normal  0.169862 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6550  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  33.7 
 
 
478 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.453687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3209  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.92 
 
 
452 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5996  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.61 
 
 
478 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.72328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2309  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.86 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5702  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  33.7 
 
 
478 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6066  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  33.7 
 
 
478 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6005  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.59 
 
 
468 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.49 
 
 
995 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5372  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.49 
 
 
481 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.420802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0754  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.39 
 
 
474 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3537  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.49 
 
 
481 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0414628  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  45.21 
 
 
999 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4732  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  36.49 
 
 
480 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3631  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.49 
 
 
480 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.572626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.84 
 
 
999 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1931  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.25 
 
 
477 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0885  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  37.88 
 
 
464 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6382  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  59.09 
 
 
474 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6213  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
474 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6615  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
474 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4425  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  31.51 
 
 
494 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0609714  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.43 
 
 
976 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  42.05 
 
 
997 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.58 
 
 
984 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.49 
 
 
995 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.49 
 
 
995 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.49 
 
 
995 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43.84 
 
 
999 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  42.86 
 
 
997 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2849  hypothetical protein  35.29 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  42.86 
 
 
997 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.49 
 
 
995 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2562  hypothetical protein  35.29 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2444  hypothetical protein  35.29 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0319375  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2888  hypothetical protein  35.29 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23366  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0747  pyridine nucleotide- disulphide oxidoreductase family protein  33.78 
 
 
477 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606696  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6626  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.88 
 
 
475 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5062  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.14 
 
 
478 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  43.84 
 
 
1000 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.85 
 
 
967 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.43 
 
 
998 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4427  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  33.78 
 
 
477 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428597  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.84 
 
 
997 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  36.36 
 
 
965 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.56 
 
 
997 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 
475 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0254  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.49 
 
 
469 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2597  hypothetical protein  34.12 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0152  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  36.49 
 
 
469 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.789884  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2843  hypothetical protein  34.12 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.21 
 
 
976 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.94 
 
 
988 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  34.21 
 
 
980 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2866  hypothetical protein  32.94 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0462239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3943  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  41.51 
 
 
463 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2640  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.98 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00475812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  37.5 
 
 
961 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
494 aa  53.9  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1167  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  52.17 
 
 
476 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  36.36 
 
 
961 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
491 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6006  oxidoreductase  41.18 
 
 
457 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195453  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31620  thioredoxin reductase  50 
 
 
488 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 
480 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
484 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4109  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.48 
 
 
501 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141512  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6586  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.88 
 
 
476 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>