62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1167 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1167  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
476 aa  947    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0221  hypothetical protein  37.55 
 
 
459 aa  293  4e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000130576  normal  0.0122393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1984  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  24.07 
 
 
576 aa  73.2  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  42.47 
 
 
500 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  42.47 
 
 
500 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  42.47 
 
 
496 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2309  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.4 
 
 
96 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  22.3 
 
 
961 aa  57  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3515  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  19.65 
 
 
469 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646311  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  24.03 
 
 
469 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0273  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  52.17 
 
 
95 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1729  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.68 
 
 
99 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3102  hydrogen cyanide synthase HcnB  19.66 
 
 
464 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36320  hydrogen cyanide synthase HcnB  18.44 
 
 
464 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.563549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1752  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.48 
 
 
91 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.77 
 
 
974 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 
492 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3209  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  16.6 
 
 
452 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  20.82 
 
 
993 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.33 
 
 
997 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  20 
 
 
993 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6293  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20 
 
 
490 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  20.31 
 
 
988 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  23.71 
 
 
1007 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  23.71 
 
 
1007 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  20.87 
 
 
1000 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2520  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.15 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.174199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2331  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  20.48 
 
 
463 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790934  normal  0.848364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  20.93 
 
 
1005 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0969  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.48 
 
 
108 aa  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00333813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3637  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  18.5 
 
 
458 aa  47.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0284637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  21.43 
 
 
1005 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  21.6 
 
 
1003 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  19.51 
 
 
937 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8301  D-nopaline dehydrogenase  21.43 
 
 
464 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.909485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  18.54 
 
 
955 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.61 
 
 
1005 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  19.23 
 
 
963 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5702  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  33.33 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6006  oxidoreductase  19.94 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195453  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  20.12 
 
 
961 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6066  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  20.7 
 
 
1000 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4435  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  22.28 
 
 
464 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  21.34 
 
 
1005 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0689  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  32.86 
 
 
483 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100515  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000039  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.94 
 
 
487 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  19.04 
 
 
993 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  31.48 
 
 
556 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  21.48 
 
 
985 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  21.36 
 
 
1005 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4414  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  22.29 
 
 
458 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160512  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6213  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  28.95 
 
 
474 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6533  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  33.33 
 
 
471 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6382  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  28.95 
 
 
474 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6550  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.48 
 
 
478 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.453687 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6615  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  28.95 
 
 
474 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4341  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  17.89 
 
 
463 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159082  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  43.48 
 
 
1002 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  43.48 
 
 
1002 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  43.48 
 
 
1002 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  43.48 
 
 
1002 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>