118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2309 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2309  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  53.57 
 
 
492 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0087  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  53.45 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000296094  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 
500 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 
500 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 
496 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0689  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  42.5 
 
 
483 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100515  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6382  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.26 
 
 
474 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6615  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.26 
 
 
474 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6213  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.26 
 
 
474 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0273  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.86 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1831  opine oxidase subunit A  38.71 
 
 
455 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000039  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.02 
 
 
487 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1167  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.4 
 
 
476 aa  60.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0969  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  39.02 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00333813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  39.02 
 
 
464 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8316  D-nopaline dehydrogenase  39.29 
 
 
469 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1837  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  37.63 
 
 
461 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4934  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.33 
 
 
460 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  37.5 
 
 
961 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1752  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  36.47 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4341  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  34.15 
 
 
463 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159082  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.82 
 
 
963 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3102  hydrogen cyanide synthase HcnB  31.76 
 
 
464 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1729  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.84 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0927  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.51 
 
 
474 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0221  hypothetical protein  40.58 
 
 
459 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000130576  normal  0.0122393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36320  hydrogen cyanide synthase HcnB  34.09 
 
 
464 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.563549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  39.02 
 
 
961 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4398  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.71 
 
 
473 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2712  D-nopaline dehydrogenase  35.29 
 
 
464 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6533  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  32.93 
 
 
471 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1688  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.5 
 
 
462 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.61791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.93 
 
 
976 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4374  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  34.94 
 
 
471 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.05 
 
 
988 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3515  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  32.14 
 
 
469 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646311  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5996  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.33 
 
 
478 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.72328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2742  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.37 
 
 
493 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  0.340256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.04 
 
 
967 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  35.16 
 
 
965 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6550  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.62 
 
 
478 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.453687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7055  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.48 
 
 
476 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.26 
 
 
968 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2520  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.21 
 
 
463 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.174199  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5702  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  39.62 
 
 
478 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6066  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.62 
 
 
478 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
983 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1984  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.63 
 
 
576 aa  47.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6005  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.52 
 
 
468 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 
556 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4414  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  31.76 
 
 
458 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160512  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8301  D-nopaline dehydrogenase  33.33 
 
 
464 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.909485  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0206  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.97 
 
 
488 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4435  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.14 
 
 
464 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  36.47 
 
 
1000 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0747  pyridine nucleotide- disulphide oxidoreductase family protein  37.18 
 
 
477 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606696  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2708  putative opine oxidase subunit a  30.68 
 
 
472 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  39.51 
 
 
997 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  42.31 
 
 
479 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1891  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  31.03 
 
 
468 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00727838  normal  0.169862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  36.07 
 
 
556 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
984 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  35.56 
 
 
968 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  34.15 
 
 
977 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3209  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.49 
 
 
452 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4427  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.18 
 
 
477 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428597  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  42.53 
 
 
960 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.29 
 
 
999 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.33 
 
 
998 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
559 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4895  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.48 
 
 
527 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.766345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  38.75 
 
 
999 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  37.18 
 
 
999 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2331  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  31.58 
 
 
463 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790934  normal  0.848364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4732  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  34.44 
 
 
480 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3631  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.44 
 
 
480 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.572626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  38.36 
 
 
995 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.09 
 
 
591 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  40 
 
 
995 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  36.67 
 
 
560 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  38.36 
 
 
995 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  36.67 
 
 
547 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4832  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.68 
 
 
504 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.619833 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 
494 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2444  hypothetical protein  30.67 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0319375  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5372  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.56 
 
 
481 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.420802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2849  hypothetical protein  30.67 
 
 
90 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4425  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  33.33 
 
 
494 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0609714  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.23 
 
 
767 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.72 
 
 
1009 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3537  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.56 
 
 
481 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0414628  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.88 
 
 
1008 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  38.57 
 
 
995 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0885  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  32.05 
 
 
464 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
461 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
514 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.57 
 
 
984 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  38.57 
 
 
995 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6626  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.18 
 
 
475 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>