288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3835 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  100 
 
 
573 aa  1193    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  36.76 
 
 
478 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  36.76 
 
 
478 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  36.58 
 
 
478 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  36.1 
 
 
487 aa  323  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  35.92 
 
 
487 aa  323  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  35.56 
 
 
482 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  35.56 
 
 
482 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  35.38 
 
 
482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  35.56 
 
 
487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  34.59 
 
 
490 aa  319  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  35.02 
 
 
490 aa  319  9e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  35.14 
 
 
485 aa  319  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  36.14 
 
 
478 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  34.59 
 
 
490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  36.15 
 
 
491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  36.46 
 
 
478 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  36.31 
 
 
478 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  35.97 
 
 
482 aa  310  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  35.96 
 
 
478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  35.96 
 
 
478 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  35.96 
 
 
478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  36.93 
 
 
624 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  35.21 
 
 
478 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  33.93 
 
 
478 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  32.04 
 
 
492 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  27.65 
 
 
564 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  34.14 
 
 
418 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  26.14 
 
 
523 aa  146  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  26.82 
 
 
572 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  25.14 
 
 
526 aa  125  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  22.94 
 
 
516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  25.35 
 
 
541 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  22.54 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  25.67 
 
 
535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  25.18 
 
 
530 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  23.5 
 
 
537 aa  111  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  23.96 
 
 
532 aa  107  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  24.54 
 
 
531 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  23.48 
 
 
685 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  22.8 
 
 
533 aa  103  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  22.57 
 
 
533 aa  99  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  23.52 
 
 
563 aa  97.4  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  23.45 
 
 
519 aa  95.1  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  23.65 
 
 
527 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.18 
 
 
495 aa  91.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  30.56 
 
 
503 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  22.89 
 
 
557 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  23.76 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  23.21 
 
 
531 aa  84.7  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  23.35 
 
 
507 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  20.7 
 
 
557 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  22.05 
 
 
576 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  22.66 
 
 
578 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  21.42 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  24.15 
 
 
527 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  23.02 
 
 
536 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.23 
 
 
469 aa  72  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  24.14 
 
 
535 aa  70.5  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  20.32 
 
 
560 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  21.73 
 
 
623 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  22.31 
 
 
496 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  34.02 
 
 
524 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  22.89 
 
 
560 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  25.4 
 
 
723 aa  65.1  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  34.55 
 
 
638 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  36.56 
 
 
560 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  35.48 
 
 
560 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  35.48 
 
 
560 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  26.94 
 
 
562 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  33.94 
 
 
528 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  23.77 
 
 
698 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  35.79 
 
 
544 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  35.79 
 
 
559 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  34.74 
 
 
565 aa  57  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  34.41 
 
 
570 aa  57  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
645 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  21.13 
 
 
529 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  30.51 
 
 
456 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  29.32 
 
 
350 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 
467 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  31.18 
 
 
572 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4445  amine oxidase  25.08 
 
 
487 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  34.34 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  46.55 
 
 
628 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  26.32 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  32.71 
 
 
501 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  36.84 
 
 
501 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  50 
 
 
445 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  22.45 
 
 
649 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  42.19 
 
 
454 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2193  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.1 
 
 
645 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000298441  normal  0.0270911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  57.78 
 
 
438 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  31.19 
 
 
505 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  36.05 
 
 
447 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  27.81 
 
 
457 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  35.63 
 
 
457 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  50 
 
 
501 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  32.89 
 
 
501 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  22.69 
 
 
426 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>