148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3888 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  100 
 
 		 541 aa  1125    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  49.24 
 
 		 537 aa  542  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  49.81 
 
 		 533 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  48.28 
 
 		 533 aa  521  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  48.59 
 
 		 535 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  50.19 
 
 		 532 aa  521  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  50.19 
 
 		 530 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  47.68 
 
 		 519 aa  502  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  45.16 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  38.9 
 
 		 528 aa  350  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  36.69 
 
 		 516 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  36.31 
 
 		 516 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  35.97 
 
 		 524 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  36.84 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  34.97 
 
 		 527 aa  293  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  32.04 
 
 		 529 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  34.23 
 
 		 531 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  34.89 
 
 		 535 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  33.65 
 
 		 527 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  34.98 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  34.03 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  33.2 
 
 		 507 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  35.64 
 
 		 520 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  27.61 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  29.44 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  27.76 
 
 		 646 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  29.9 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  30.11 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  29.92 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  29.88 
 
 		 478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.1 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.1 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.95 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  24.74 
 
 		 478 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.74 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.74 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  26.48 
 
 		 487 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  26.45 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.54 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.9 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.7 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  25.75 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  25.75 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25.75 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.7 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  24.74 
 
 		 478 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  25.55 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  25.9 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.9 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.67 
 
 		 478 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  24.09 
 
 		 644 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  34.58 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  26.64 
 
 		 503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  25.35 
 
 		 573 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  25.05 
 
 		 564 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.13 
 
 		 523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  29.23 
 
 		 624 aa  97.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  23.31 
 
 		 685 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  22.89 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  26.57 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  22.89 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  21.64 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  21.16 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  21.64 
 
 		 578 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  22.6 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  22.26 
 
 		 576 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  35.92 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  21.77 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  25.26 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  39.42 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  23.73 
 
 		 544 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  26.29 
 
 		 592 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  23.73 
 
 		 559 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  21.42 
 
 		 565 aa  54.3  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  35.29 
 
 		 647 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  35.29 
 
 		 647 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  19.91 
 
 		 456 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  22.22 
 
 		 575 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  22.68 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  23.58 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  24.23 
 
 		 560 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  26 
 
 		 565 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  45.45 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.2 
 
 		 619 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.19 
 
 		 459 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.2 
 
 		 616 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  22.78 
 
 		 572 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  40 
 
 		 537 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.8 
 
 		 619 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  34.74 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  45.1 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  22.73 
 
 		 556 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  47.06 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  30.53 
 
 		 645 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  29.91 
 
 		 495 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  51.11 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  24.64 
 
 		 469 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  51.11 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  58.97 
 
 		 419 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  30.66 
 
 		 515 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>