88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2670 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  67.87 
 
 
560 aa  801    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  57.96 
 
 
570 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  58.15 
 
 
578 aa  689    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  67.87 
 
 
560 aa  803    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  68.59 
 
 
560 aa  808    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  59.13 
 
 
580 aa  687    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  68.05 
 
 
560 aa  805    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  100 
 
 
556 aa  1125    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  58.27 
 
 
576 aa  683    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  70.04 
 
 
560 aa  832    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  68.3 
 
 
559 aa  813    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  69.24 
 
 
544 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  56.37 
 
 
566 aa  627  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  55.17 
 
 
572 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  53.27 
 
 
565 aa  599  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  37.6 
 
 
623 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  35.28 
 
 
649 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  31.93 
 
 
563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  28.42 
 
 
575 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  31.93 
 
 
557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  29.76 
 
 
562 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  27.71 
 
 
723 aa  187  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  22.24 
 
 
564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.31 
 
 
492 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.01 
 
 
523 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  26.27 
 
 
803 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  23.62 
 
 
644 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  23.37 
 
 
478 aa  87  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  23.9 
 
 
572 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  23.92 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  23.24 
 
 
491 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  21.23 
 
 
487 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  21.03 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  21.03 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  21.03 
 
 
485 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  21.03 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  21.03 
 
 
487 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  20.83 
 
 
482 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  21.41 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  21.03 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  21.03 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  24.41 
 
 
519 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  20.69 
 
 
527 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.5 
 
 
478 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.5 
 
 
478 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  27.68 
 
 
503 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  21.27 
 
 
573 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  20.86 
 
 
478 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.14 
 
 
478 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.68 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  24.73 
 
 
478 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.27 
 
 
478 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.27 
 
 
478 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.59 
 
 
478 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  32.59 
 
 
707 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  43.21 
 
 
469 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  28.19 
 
 
530 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  36.11 
 
 
532 aa  50.8  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.04 
 
 
478 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  23.31 
 
 
526 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  22.73 
 
 
541 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  25.54 
 
 
624 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  34.74 
 
 
157 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  37.04 
 
 
594 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  37.04 
 
 
594 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  37.04 
 
 
594 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  45.31 
 
 
480 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  27.88 
 
 
533 aa  47  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  40.32 
 
 
698 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  48.15 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  33.65 
 
 
533 aa  47  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  25.97 
 
 
418 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  23.17 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
510 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  33.65 
 
 
537 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  36 
 
 
435 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  18.48 
 
 
516 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  18.48 
 
 
516 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  40 
 
 
989 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
519 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  20.8 
 
 
528 aa  44.3  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  24.7 
 
 
531 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  24.16 
 
 
535 aa  43.9  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1491  hypothetical protein  41.18 
 
 
587 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.287152  normal  0.0494428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  40.28 
 
 
511 aa  43.9  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  24.16 
 
 
435 aa  43.9  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  31.01 
 
 
507 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  46.3 
 
 
628 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>